Protein IDs Majority protein IDs Peptide counts (all) Peptide counts (razor+unique) Peptide counts (unique) Protein names Gene names Fasta headers Number of proteins Peptides Razor + unique peptides Unique peptides Peptides Exp 1 Peptides Exp 2 Peptides Exp 3 Razor + unique peptides Exp 1 Razor + unique peptides Exp 2 Razor + unique peptides Exp 3 Unique peptides Exp 1 Unique peptides Exp 2 Unique peptides Exp 3 Sequence coverage [%] Unique + razor sequence coverage [%] Unique sequence coverage [%] Mol. weight [kDa] Sequence length Sequence lengths Fraction average Fraction 1 Fraction 2 Fraction 3 Fraction 4 Fraction 5 Fraction 6 Fraction 7 Fraction 8 Fraction 9 Fraction 10 Q-value Score Identification type Exp 1 Identification type Exp 2 Identification type Exp 3 Sequence coverage Exp 1 [%] Sequence coverage Exp 2 [%] Sequence coverage Exp 3 [%] Intensity Intensity Exp 1 Intensity Exp 2 Intensity Exp 3 LFQ intensity Exp 1 LFQ intensity Exp 2 LFQ intensity Exp 3 MS/MS count Exp 1 MS/MS count Exp 2 MS/MS count Exp 3 MS/MS count Only identified by site Reverse Potential contaminant id Peptide IDs Peptide is razor Mod. peptide IDs Evidence IDs MS/MS IDs Best MS/MS Oxidation (M) site IDs Oxidation (M) site positions A0A075B6K5;P80748 A0A075B6K5;P80748 1;1 1;1 1;1 Ig lambda chain V-III region LOI IGLV3-9 sp|A0A075B6K5|LV39_HUMAN Immunoglobulin lambda variable 3-9 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=IGLV3-9 PE=3 SV=1;sp|P80748|LV321_HUMAN Immunoglobulin lambda variable 3-21 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=IGLV3-21 PE=1 SV=2 2 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 13.9 13.9 13.9 12.332 115 115;117 9.5 1 1 0 77.855 By MS/MS 13.9 0 0 8271500 8271500 0 0 7472500 0 0 2 0 0 2 0 3974 True 4141 16337;16338 13502;13503 13502 A2NJV5;A0A0A0MRZ7;A0A075B6S6;A0A075B6S2;A0A075B6P5;A0A087WW87;P06310;P01615;P01614 A2NJV5;A0A0A0MRZ7;A0A075B6S6;A0A075B6S2;A0A075B6P5;A0A087WW87;P06310;P01615;P01614 1;1;1;1;1;1;1;1;1 1;1;1;1;1;1;1;1;1 1;1;1;1;1;1;1;1;1 Ig kappa chain V-II region RPMI 6410;Ig kappa chain V-II region FR;Ig 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ribonucleoprotein G-like protein 15 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SNRPGP15 PE=5 SV=2 2 3 3 3 1 3 3 1 3 3 1 3 3 26.3 26.3 26.3 8.496 76 76;76 9.25 1 3 3 9 0 18.922 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 9.2 26.3 26.3 403020000 6658400 94117000 302240000 0 636550000 370570000 3 5 8 16 19 4820;4821;5635 True;True;True 5023;5024;5025;5870 20353;20354;20355;20356;20357;20358;20359;20360;20361;23800;23801;23802;23803;23804;23805;23806 17076;17077;17078;17079;17080;17081;20104;20105;20106;20107;20108;20109;20110;20111;20112;20113;20114 17077;17081;20112 5 69 B3EUR6 B3EUR6 1 1 1 sp|B3EUR6|PB2_I61A1 Polymerase basic protein 2 OS=Influenza A virus (strain A/Swine/Wisconsin/1/1961 H1N1) OX=383533 GN=PB2 PE=3 SV=1 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 1.8 1.8 1.8 85.83 759 759 5 1 1 -2 By MS/MS 0 0 1.8 6848100 0 0 6848100 0 0 955190 0 0 0 0 + 20 1976 True 2060 8414 6930 6930 6 11 Q99613;B5ME19 Q99613;B5ME19 5;5 5;5 5;5 Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C;Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C-like protein EIF3C;EIF3CL sp|Q99613|EIF3C_HUMAN Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EIF3C PE=1 SV=1;sp|B5ME19|EIFCL_HUMAN Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C-like protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EIF3CL PE=1 SV=1 2 5 5 5 1 3 4 1 3 4 1 3 4 8.3 8.3 8.3 105.34 913 913;914 1.89 1 8 0 46.987 By matching By MS/MS By MS/MS 1.1 3.8 6.6 30518000 334680 7535100 22648000 0 0 5102500 0 2 3 5 21 2978;3577;6106;9649;13046 True;True;True;True;True 3101;3725;6364;10093;13717 12363;12364;12365;14612;14613;14614;26045;41132;56745 10095;10096;11980;11981;22027;34254;47410 10096;11981;22027;34254;47410 B7ZAP0 B7ZAP0 2 2 2 Rab GTPase-activating protein 1-like, isoform 10 RABGAP1L sp|B7ZAP0|RBG10_HUMAN Rab GTPase-activating protein 1-like, isoform 10 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RABGAP1L PE=1 SV=1 1 2 2 2 0 0 2 0 0 2 0 0 2 7.1 7.1 7.1 29.038 253 253 3.5 1 1 0 12.373 By MS/MS 0 0 7.1 508620000 0 0 508620000 0 0 84366000 0 0 2 2 22 6412;7185 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Y-chromosomal OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EIF1AY PE=1 SV=4 2 5 5 5 1 4 5 1 4 5 1 4 5 36.8 36.8 36.8 16.46 144 144;144 7.53 1 1 3 9 1 0 42.204 By matching By MS/MS By MS/MS 8.3 36.1 36.8 190380000 6715000 11604000 172060000 0 8920600 23437000 0 3 8 11 138 1503;2380;3054;7318;15358 True;True;True;True;True 1574;2484;3178;7618;16106 6674;6675;6676;10086;10087;10088;10089;10090;12655;12656;12657;31171;67236;67237;67238 5565;8236;8237;10351;10352;10353;10354;10355;26312;56711;56712;56713 5565;8236;10355;26312;56711 O14617 O14617 15 15 15 AP-3 complex subunit delta-1 AP3D1 sp|O14617|AP3D1_HUMAN AP-3 complex subunit delta-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AP3D1 PE=1 SV=1 1 15 15 15 3 4 15 3 4 15 3 4 15 20.6 20.6 20.6 130.16 1153 1153 2 10 20 8 1 0 152.86 By matching By MS/MS By MS/MS 3.2 4.9 20.6 212020000 12606000 15553000 183860000 15039000 12827000 33931000 0 4 20 24 139 694;699;1890;2327;3176;3528;4778;6169;7777;8543;9370;10651;15213;15862;15883 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20103;22100;39210;41877 O15479 O15479 2 2 2 Melanoma-associated antigen B2 MAGEB2 sp|O15479|MAGB2_HUMAN Melanoma-associated antigen B2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MAGEB2 PE=1 SV=3 1 2 2 2 0 1 2 0 1 2 0 1 2 7.5 7.5 7.5 35.277 319 319 5.67 1 2 0 15.309 By MS/MS By MS/MS 0 2.5 7.5 2429500 0 1462100 967410 0 0 144740 0 1 1 2 183 1044;3922 True;True 1099;4087 4555;16168;16169 3787;13368 3787;13368 O15504 O15504 2 2 2 Nucleoporin-like protein 2 NUPL2 sp|O15504|NUP42_HUMAN Nucleoporin NUP42 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NUP42 PE=1 SV=1 1 2 2 2 0 1 1 0 1 1 0 1 1 9.2 9.2 9.2 44.871 423 423 5 2 0 18.262 By MS/MS By MS/MS 0 5.9 3.3 9618700 0 5233800 4384900 0 1349100 0 0 0 1 1 184 1865;12393 True;True 1947;13045 8122;53894 6732;45045 6732;45045 O15525;O60675 O15525;O60675 2;1 2;1 1;0 Transcription factor MafG;Transcription factor MafK MAFG;MAFK sp|O15525|MAFG_HUMAN Transcription factor MafG OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MAFG PE=1 SV=1;sp|O60675|MAFK_HUMAN Transcription factor MafK OS=Homo sapiens 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17115;21417 O43491 O43491 6 6 6 Band 4.1-like protein 2 EPB41L2 sp|O43491|E41L2_HUMAN Band 4.1-like protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EPB41L2 PE=1 SV=1 1 6 6 6 0 6 3 0 6 3 0 6 3 8.7 8.7 8.7 112.59 1005 1005 2.33 6 3 0 43.958 By MS/MS By matching 0 8.7 4.3 20358000 0 11630000 8728000 0 4888800 2041300 0 6 0 6 199 4738;12145;13043;13727;14521;15047 True;True;True;True;True;True 4938;12779;13714;14425;15248;15789 19996;52720;52721;56740;59949;59950;63875;63876;65965 16786;44005;47407;50168;53896;55607 16786;44005;47407;50168;53896;55607 O43504 O43504 1 1 1 Ragulator complex protein LAMTOR5 LAMTOR5 sp|O43504|LTOR5_HUMAN Ragulator complex protein LAMTOR5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=LAMTOR5 PE=1 SV=1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 22 22 22 9.6138 91 91 10 2 0.0010493 9.511 By MS/MS By MS/MS 0 22 22 9600800 0 7080500 2520300 0 0 5512200 0 1 1 2 200 5061 True 5269 21316;21317 17951;17952 17951 O43548 O43548 1 1 1 Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 5 TGM5 sp|O43548|TGM5_HUMAN Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TGM5 PE=1 SV=4 1 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 2.1 2.1 2.1 80.777 720 720 5.4 1 1 1 1 1 0.0010111 7.6998 By MS/MS 2.1 0 0 2609500 2609500 0 0 2235000 0 0 1 0 0 1 201 1083 True 1140 4681;4682;4683;4684;4685 3886;3887 3887 O43583 O43583 4 4 4 Density-regulated protein DENR sp|O43583|DENR_HUMAN Density-regulated protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DENR PE=1 SV=2 1 4 4 4 0 2 4 0 2 4 0 2 4 22.7 22.7 22.7 22.092 198 198 6 6 0 102.8 By matching By MS/MS 0 14.1 22.7 39597000 0 4301900 35295000 0 3067900 3701700 0 0 5 5 202 7554;10845;10846;15457 True;True;True;True 7865;11423;11424;16207 32197;32198;46959;46960;46961;67604 27151;27152;39136;39137;56999 27152;39136;39137;56999 O43615 O43615 4 4 4 Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44 TIMM44 sp|O43615|TIM44_HUMAN Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TIMM44 PE=1 SV=2 1 4 4 4 2 0 3 2 0 3 2 0 3 10.4 10.4 10.4 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O43852 2 2 2 Calumenin CALU sp|O43852|CALU_HUMAN Calumenin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CALU PE=1 SV=2 1 2 2 2 0 1 2 0 1 2 0 1 2 6.7 6.7 6.7 37.106 315 315 5.75 2 1 1 0 15.087 By matching By MS/MS 0 4.1 6.7 13934000 0 997630 12936000 0 0 1941400 0 0 3 3 217 5468;15425 True;True 5692;16175 22917;22918;22919;67515 19309;19310;56936 19309;56936 O43913 O43913 2 2 2 Origin recognition complex subunit 5 ORC5 sp|O43913|ORC5_HUMAN Origin recognition complex subunit 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ORC5 PE=1 SV=1 1 2 2 2 1 1 2 1 1 2 1 1 2 4.8 4.8 4.8 50.282 435 435 4.5 3 3 0 18.677 By matching By MS/MS By MS/MS 2.1 2.1 4.8 29721000 5966800 2701400 21053000 0 0 3098500 0 1 3 4 218 2043;8337 True;True 2131;8678 8717;8718;35684;35685;35686;35687 7160;7161;29939;29940 7161;29940 O60216;Q9H4I0 O60216 14;1 14;1 14;1 Double-strand-break repair protein rad21 homolog RAD21 sp|O60216|RAD21_HUMAN Double-strand-break repair protein rad21 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RAD21 PE=1 SV=2 2 14 14 14 3 7 14 3 7 14 3 7 14 33.3 33.3 33.3 71.689 631 631;556 2.69 9 25 13 8 3 2 1 0 181.87 By matching By MS/MS By MS/MS 4.9 13 33.3 533350000 9069700 71781000 452500000 22547000 35386000 73770000 0 11 32 43 219 1108;1109;2297;2411;2649;4144;4436;6316;7822;8774;9440;13484;13639;14172 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1165;1166;2399;2517;2763;4317;4625;6586;8144;9136;9817;14172;14331;14884 4796;4797;4798;4799;4800;4801;4802;4803;9764;9765;9766;9767;9768;10303;11087;16979;16980;16981;16982;16983;16984;16985;16986;16987;18313;18314;26906;33323;33324;33325;33326;33327;33328;33329;33330;33331;37507;37508;37509;39994;39995;39996;39997;39998;39999;58953;58954;58955;59496;59497;59498;59499;59500;59501;59502;59503;59504;59505;59506;59507;62275 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chromatin subfamily A member 5 SMARCA5 sp|O60264|SMCA5_HUMAN SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SMARCA5 PE=1 SV=1 1 45 45 31 7 26 41 7 26 41 3 14 29 47.1 47.1 37.2 121.9 1052 1052 1.8 51 91 17 1 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 6.4 27.5 41.7 2898100000 271150000 429900000 2197000000 98614000 233280000 631650000 2 33 80 115 223 981;988;1000;1698;2308;2836;3261;3730;4068;4480;5686;5748;5749;5939;6271;6788;7580;7619;7768;7881;8001;8384;8469;8470;8905;9213;10061;10157;10399;10400;11080;11099;11184;11600;12567;12700;12701;13049;13424;13529;14575;14657;15416;15734;15805 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 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pre-ribosomal-associated protein 1 URB1 sp|O60287|NPA1P_HUMAN Nucleolar pre-ribosomal-associated protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=URB1 PE=1 SV=4 1 18 18 18 0 8 13 0 8 13 0 8 13 10.4 10.4 10.4 254.39 2271 2271 1.15 23 2 1 0 134.2 By MS/MS By MS/MS 0 3.4 8.2 111900000 0 23428000 88467000 0 12920000 17571000 0 8 14 22 224 279;571;1074;1341;2661;3920;4053;4476;6194;6727;8462;8994;9712;12296;12731;13455;13581;16033 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 289;594;1131;1405;2775;4085;4223;4670;6453;7014;8806;9360;10175;12936;13390;14138;14272;16799 1140;1141;1142;2379;4653;5917;11123;11124;16165;16166;16696;16697;18691;26371;28702;36212;36213;38299;41399;41400;53481;55446;55447;58718;59308;70035 919;1945;3868;4908;9034;9035;13365;13366;13840;13841;15494;22292;24315;30385;32058;34439;34440;44714;46365;46366;49150;49647;58983 919;1945;3868;4908;9035;13366;13840;15494;22292;24315;30385;32058;34440;44714;46366;49150;49647;58983 O60306 O60306 24 24 23 Intron-binding protein aquarius AQR sp|O60306|AQR_HUMAN RNA helicase aquarius OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AQR PE=1 SV=4 1 24 24 23 2 12 21 2 12 21 1 11 20 25.7 25.7 25.3 171.29 1485 1485 1.65 24 33 3 0 195.52 By matching By MS/MS By MS/MS 1.1 11.4 22.7 297330000 7571600 68867000 220890000 14789000 50480000 22548000 0 12 27 39 225 67;497;1416;1761;5023;5891;6543;7732;7899;8579;9462;9677;9775;10005;10727;11306;11378;11485;12545;12988;13359;13360;14436;15942 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 68;516;1483;1840;5231;6137;6822;8049;8227;8931;9846;10133;10253;10532;11299;11893;11968;12078;13200;13655;14039;14040;15158;16706 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mitochondrial MRPS14 sp|O60783|RT14_HUMAN 28S ribosomal protein S14, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MRPS14 PE=1 SV=1 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 11.7 11.7 11.7 15.139 128 128 9 1 0.00099701 7.4988 By MS/MS 0 0 11.7 5756400 0 0 5756400 0 0 1838800 0 0 1 1 232 6226 True 6487 26503 22393 22393 O60784 O60784 2 2 2 Target of Myb protein 1 TOM1 sp|O60784|TOM1_HUMAN Target of Myb protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TOM1 PE=1 SV=2 1 2 2 2 0 1 2 0 1 2 0 1 2 5.9 5.9 5.9 53.818 492 492 3.67 2 4 0 17.505 By MS/MS By MS/MS 0 3.3 5.9 12546000 0 5928200 6617500 0 0 1132400 0 2 3 5 233 9485;14699 True;True 9874;9875;15431 40214;40215;40216;40217;40218;64593 33494;33495;33496;33497;54475 33494;54475 95 1 O60828 O60828 3 3 3 Polyglutamine-binding protein 1 PQBP1 sp|O60828|PQBP1_HUMAN Polyglutamine-binding protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PQBP1 PE=1 SV=1 1 3 3 3 0 3 3 0 3 3 0 3 3 17.4 17.4 17.4 30.472 265 265 6.27 8 3 0 45.025 By MS/MS By MS/MS 0 17.4 17.4 65504000 0 24255000 41249000 0 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Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 24 MED24 sp|O75448|MED24_HUMAN Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 24 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MED24 PE=1 SV=1 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 1.6 1.6 1.6 110.3 989 989 2.5 1 1 0.0066079 6.2025 By MS/MS 0 0 1.6 1314400 0 0 1314400 0 0 271100 0 0 1 1 261 12410 True 13062 53952;53953 45093 45093 O75475 O75475 16 16 15 PC4 and SFRS1-interacting protein PSIP1 sp|O75475|PSIP1_HUMAN PC4 and SFRS1-interacting protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PSIP1 PE=1 SV=1 1 16 16 15 0 9 15 0 9 15 0 8 14 34.3 34.3 32.8 60.103 530 530 3.77 10 10 28 16 13 9 7 1 0 323.31 By MS/MS By MS/MS 0 18.1 34.2 1273600000 0 99496000 1174100000 0 52251000 184820000 0 14 58 72 262 1685;1784;4396;5228;5595;5596;5776;6913;7187;8652;10342;10850;11162;13391;14088;15110 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1758;1865;4584;5442;5826;5827;6016;7204;7482;9009;10888;10889;11428;11746;14072;14799;15852 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tail-binding protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CD2BP2 PE=1 SV=1 1 2 2 2 0 0 2 0 0 2 0 0 2 6.2 6.2 6.2 37.646 341 341 4.75 1 2 1 0.00053505 10.933 By MS/MS 0 0 6.2 20522000 0 0 20522000 0 0 3220200 0 0 2 2 324 2211;4816 True;True 2309;5019 9373;20331;20332;20333 7692;17059 7692;17059 O95425 O95425 14 14 14 Supervillin SVIL sp|O95425|SVIL_HUMAN Supervillin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SVIL PE=1 SV=2 1 14 14 14 1 9 13 1 9 13 1 9 13 9.5 9.5 9.5 247.74 2214 2214 1.39 21 8 2 0 122.06 By matching By MS/MS By MS/MS 0.6 6.9 8.6 150160000 2874600 59825000 87461000 0 28926000 18975000 0 12 12 24 325 60;1174;1620;3110;4010;5215;8081;9905;12494;13264;13288;13597;14345;15904 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 61;1231;1692;3238;4178;5429;8415;10428;13147;13941;13965;14288;15064;16667 169;170;171;5132;5133;7126;7127;12835;16500;21877;34491;34492;34493;34494;42419;42420;54216;54217;57639;57640;57641;57939;57940;57941;59364;59365;59366;59367;63122;69540;69541 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1 SGPL1 sp|O95470|SGPL1_HUMAN Sphingosine-1-phosphate lyase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SGPL1 PE=1 SV=3 1 6 6 6 0 3 6 0 3 6 0 3 6 15.8 15.8 15.8 63.523 568 568 3.77 1 2 9 1 0 53.182 By MS/MS By MS/MS 0 7.4 15.8 124740000 0 26361000 98375000 0 13789000 11845000 0 3 7 10 328 402;849;1502;9096;13532;13733 True;True;True;True;True;True 417;888;1573;9465;14222;14433 1620;3643;3644;3645;3646;3647;6672;6673;38713;38714;59148;60049;60050 1300;2960;2961;2962;5563;5564;32398;32399;49507;50276 1300;2960;5564;32398;49507;50276 O95478 O95478 3 3 3 Ribosome biogenesis protein NSA2 homolog NSA2 sp|O95478|NSA2_HUMAN Ribosome biogenesis protein NSA2 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NSA2 PE=1 SV=1 1 3 3 3 1 3 3 1 3 3 1 3 3 14.6 14.6 14.6 30.065 260 260 6.2 1 7 1 1 0 22.282 By matching By MS/MS By MS/MS 5.8 14.6 14.6 175020000 3401100 31633000 139980000 0 10495000 21387000 0 2 5 7 329 10426;10756;13584 True;True;True 10981;11330;14275 45095;45096;45097;46620;46621;59314;59315;59316;59317;59318 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subunit alpha-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AP2A1 PE=1 SV=3 1 16 11 11 2 9 11 1 7 7 1 7 7 22 16 16 107.54 977 977 1.94 1 16 0 94.293 By matching By MS/MS By MS/MS 2.3 12.2 15.5 103910000 2015200 30620000 71278000 0 12316000 16836000 0 8 7 15 339 810;1303;1693;3620;3717;4645;5687;6257;7713;8289;9943;12627;13172;13707;14352;15631 False;True;True;True;True;False;False;True;True;True;False;True;True;True;False;True 844;1365;1766;3772;3773;3871;4844;5924;6518;8028;8630;10469;13285;13847;14403;15071;16383 3430;3431;3432;5770;7436;7437;14824;14825;14826;14827;15253;19678;23965;26666;32809;35519;42536;54904;54905;57170;57171;59851;63145;63146;63147;68318 2810;4803;6190;6191;12143;12144;12145;12146;12501;16568;20252;22532;27616;29807;35366;45874;47725;50094;53339;53340;53341;57602 2810;4803;6191;12146;12501;16568;20252;22532;27616;29807;35366;45874;47725;50094;53341;57602 118 870 O95785 O95785 8 8 8 Protein Wiz WIZ sp|O95785|WIZ_HUMAN Protein Wiz OS=Homo sapiens OX=9606 GN=WIZ PE=1 SV=2 1 8 8 8 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25450;28360;30877 P02794 P02794 4 4 4 Ferritin heavy chain;Ferritin heavy chain, N-terminally processed FTH1 sp|P02794|FRIH_HUMAN Ferritin heavy chain OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FTH1 PE=1 SV=2 1 4 4 4 0 3 3 0 3 3 0 3 3 17.5 17.5 17.5 21.225 183 183 7.33 7 1 1 0 39.992 By MS/MS By MS/MS 0 12 11.5 55331000 0 16665000 38666000 0 8875400 7834400 0 2 4 6 403 2943;2944;10601;15600 True;True;True;True 3066;3067;11169;16352 12256;12257;12258;12259;45815;68209;68210;68211;68212 10020;10021;10022;38115;57524;57525 10020;10022;38115;57524 P02814 P02814 2 2 2 Submaxillary gland androgen-regulated protein 3B;Peptide P-A;Peptide D1A SMR3B sp|P02814|SMR3B_HUMAN Submaxillary gland androgen-regulated protein 3B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SMR3B PE=1 SV=2 1 2 2 2 2 1 0 2 1 0 2 1 0 65.8 65.8 65.8 8.1875 79 79 7.83 1 1 2 2 0 14.05 By MS/MS By matching 65.8 26.6 0 10040000 9386600 653650 0 7604600 0 0 7 0 0 7 404 4909;6374 True;True 5114;6646 20633;20634;27105;27106;27107;27108 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activator inhibitor 2 SERPINB2 sp|P05120|PAI2_HUMAN Plasminogen activator inhibitor 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SERPINB2 PE=1 SV=2 1 2 2 2 2 1 1 2 1 1 2 1 1 7 7 7 46.596 415 415 1.83 3 1 2 0 14.054 By MS/MS By matching By matching 7 4.8 2.2 16853000 13563000 1632700 1657100 15070000 0 0 2 0 0 2 426 12268;13607 True;True 12908;14298 53329;53330;59405;59406;59407;59408 44591;49725 44591;49725 P05141;Q9H0C2 P05141 14;4 14;4 6;0 ADP/ATP translocase 2;ADP/ATP translocase 2, N-terminally processed SLC25A5 sp|P05141|ADT2_HUMAN ADP/ATP translocase 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLC25A5 PE=1 SV=7 2 14 14 6 5 10 12 5 10 12 1 3 5 40.9 40.9 19.5 32.852 298 298;315 6.1 8 1 1 3 23 13 3 3 7 0 127 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 16.1 30.2 35.9 1071200000 30976000 293160000 747100000 40184000 127110000 186170000 3 18 29 50 427 189;1687;3184;4238;4787;4813;5036;6937;8367;10940;12936;12958;15603;15604 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 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17;8;8;8;8 17;8;8;8;8 17;8;8;8;8 Heterogeneous nuclear ribonucleoproteins C1/C2 HNRNPC sp|P07910|HNRPC_HUMAN Heterogeneous nuclear ribonucleoproteins C1/C2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HNRNPC PE=1 SV=4 5 17 17 17 6 17 13 6 17 13 6 17 13 41.8 41.8 41.8 33.67 306 306;293;293;293;293 5.54 5 8 11 15 34 69 17 10 5 5 0 242.9 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 20.9 41.8 28.8 11230000000 283290000 5585500000 5360800000 731200000 1760900000 581020000 10 106 67 183 467 165;1231;4248;4334;7232;8150;8151;9633;9926;9987;10827;10980;11769;14133;14278;14279;14936 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 168;1290;4426;4517;7527;8487;8488;10073;10074;10450;10451;10513;11404;11405;11562;12384;14844;14995;14996;15677 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branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase complex, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DBT PE=1 SV=3 1 8 8 8 1 5 6 1 5 6 1 5 6 21.8 21.8 21.8 53.486 482 482 4.5 11 11 0 52.728 By matching By MS/MS By MS/MS 2.7 12.9 17.6 133120000 6063000 17563000 109490000 0 6318300 15416000 0 4 13 17 519 1099;2057;6177;8894;8960;10784;12841;14187 True;True;True;True;True;True;True;True 1156;2148;6435;9260;9326;11359;13505;14901 4764;4765;4766;4767;4768;8789;8790;8791;8792;26265;26266;26267;37904;38188;46677;46678;46679;46680;46681;55888;55889;62345 3950;3951;3952;7218;7219;7220;7221;22196;22197;22198;31743;31975;38860;38861;38862;46734;52644 3952;7220;22197;31743;31975;38862;46734;52644 P11217;P11216;P06737 P11217;P11216;P06737 2;1;1 2;1;1 2;1;1 Glycogen phosphorylase, muscle form;Glycogen phosphorylase, brain form;Glycogen phosphorylase, liver form PYGM;PYGB;PYGL sp|P11217|PYGM_HUMAN Glycogen phosphorylase, muscle form OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PYGM PE=1 SV=6;sp|P11216|PYGB_HUMAN Glycogen 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Lysosome-associated membrane glycoprotein 2 LAMP2 sp|P13473|LAMP2_HUMAN Lysosome-associated membrane glycoprotein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=LAMP2 PE=1 SV=2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 2 44.96 410 410 4.12 1 3 1 1 1 1 0.002412 7.1762 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 2 2 2 15584000 6493100 1958900 7131700 0 0 1989900 2 1 1 4 545 6368 True 6640 27082;27083;27084;27085;27086;27087;27088;27089 22895;22896;22897;22898 22898 P13489 P13489 2 2 2 Ribonuclease inhibitor RNH1 sp|P13489|RINI_HUMAN Ribonuclease inhibitor OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RNH1 PE=1 SV=2 1 2 2 2 0 1 2 0 1 2 0 1 2 5.6 5.6 5.6 49.973 461 461 5 3 0 50.715 By MS/MS By MS/MS 0 2.4 5.6 29688000 0 11169000 18519000 0 0 2583000 0 1 2 3 546 3036;14869 True;True 3160;15610 12555;65265;65266 10250;55012;55013 10250;55012 P13639 P13639 15 15 15 Elongation factor 2 EEF2 sp|P13639|EF2_HUMAN Elongation factor 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EEF2 PE=1 SV=4 1 15 15 15 9 12 15 9 12 15 9 12 15 21.1 21.1 21.1 95.337 858 858 3.35 15 35 15 10 4 4 6 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GN=PRKAR2A PE=1 SV=2;sp|P31323|KAP3_HUMAN cAMP-dependent protein kinase type II-beta regulatory subunit OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PRKAR2B PE=1 SV=3 2 2 2 2 0 2 0 0 2 0 0 2 0 7.2 7.2 7.2 45.518 404 404;418 4.67 1 2 0 13.023 By MS/MS 0 7.2 0 9233700 0 9233700 0 0 2455800 0 0 2 0 2 553 4959;4976 True;True 5167;5184 20804;20879;20880 17451;17515 17451;17515 P13984 P13984 2 2 2 General transcription factor IIF subunit 2 GTF2F2 sp|P13984|T2FB_HUMAN General transcription factor IIF subunit 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GTF2F2 PE=1 SV=2 1 2 2 2 0 0 2 0 0 2 0 0 2 12.4 12.4 12.4 28.38 249 249 6 3 0 18.99 By MS/MS 0 0 12.4 56682000 0 0 56682000 0 0 8480200 0 0 3 3 554 8788;15329 True;True 9150;16076 37579;67158;67159 31488;56624;56625 31488;56624 P13995 P13995 1 1 1 Bifunctional methylenetetrahydrofolate dehydrogenase/cyclohydrolase, mitochondrial;NAD-dependent methylenetetrahydrofolate dehydrogenase;Methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase MTHFD2 sp|P13995|MTDC_HUMAN Bifunctional methylenetetrahydrofolate dehydrogenase/cyclohydrolase, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MTHFD2 PE=1 SV=2 1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 3.1 3.1 3.1 37.895 350 350 3.17 1 1 2 1 1 0.0095694 6.0855 By matching By MS/MS 3.1 0 3.1 51902000 29117000 0 22785000 0 0 3843700 0 0 1 1 555 9240 True 9614 39261;39262;39263;39264;39265;39266 32770 32770 P14174 P14174 1 1 1 Macrophage migration inhibitory factor MIF sp|P14174|MIF_HUMAN Macrophage migration inhibitory factor OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MIF PE=1 SV=4 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 9.6 9.6 9.6 12.476 115 115 9.22 2 3 4 0 76.647 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 9.6 9.6 9.6 78297000 1654800 21631000 55011000 0 0 11708000 2 3 3 8 556 10745 True 11317;11318;11319 46572;46573;46574;46575;46576;46577;46578;46579;46580 38779;38780;38781;38782;38783;38784;38785;38786;38787 38785 245 3 P14373;Q9HCM9 P14373 5;1 5;1 5;1 Zinc finger protein RFP TRIM27 sp|P14373|TRI27_HUMAN Zinc finger protein RFP OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TRIM27 PE=1 SV=1 2 5 5 5 0 1 5 0 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21032;23752 P14649 P14649 4 1 1 Myosin light chain 6B MYL6B sp|P14649|MYL6B_HUMAN Myosin light chain 6B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MYL6B PE=1 SV=1 1 4 1 1 2 4 3 0 1 1 0 1 1 18.8 4.3 4.3 22.764 208 208 7 2 0.0010256 8.0481 By matching By MS/MS By MS/MS 11.5 18.8 15.9 12754000 0 5490200 7263800 0 0 1288900 0 1 1 2 562 765;766;5630;6268 False;False;True;False 798;799;5865;6530 3275;3276;3277;3278;3279;3280;3281;3282;3283;3284;23785;23786;26705;26706;26707;26708;26709 2698;2699;2700;2701;2702;2703;2704;2705;2706;2707;20085;20086;22558;22559;22560 2704;2707;20085;22560 P14678;P63162 P14678;P63162 7;5 7;5 7;5 Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B;Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N SNRPB;SNRPN sp|P14678|RSMB_HUMAN Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SNRPB PE=1 SV=2;sp|P63162|RSMN_HUMAN Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SNRPN PE=1 SV=1 2 7 7 7 4 6 7 4 6 7 4 6 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P15170 4 1 1 Eukaryotic peptide chain release factor GTP-binding subunit ERF3A GSPT1 sp|P15170|ERF3A_HUMAN Eukaryotic peptide chain release factor GTP-binding subunit ERF3A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GSPT1 PE=1 SV=1 1 4 1 1 0 4 1 0 1 1 0 1 1 9.2 3.4 3.4 55.755 499 499 2.67 1 2 0.0062978 6.3433 By MS/MS By MS/MS 0 9.2 3.4 8751200 0 2963600 5787500 0 0 1201000 0 1 1 2 568 4941;5316;5430;12691 False;False;False;True 5147;5536;5653;13349 20739;20740;22218;22697;55265;55266;55267 17404;18666;19083;46209;46210 17404;18666;19083;46209 P15311 P15311 14 6 6 Ezrin EZR sp|P15311|EZRI_HUMAN Ezrin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EZR PE=1 SV=4 1 14 6 6 4 10 12 2 2 6 2 2 6 21.5 12.1 12.1 69.412 586 586 3.07 2 9 3 0 42.586 By matching By MS/MS By MS/MS 6.5 14 20.1 73474000 8936300 5980300 58558000 10469000 5545800 8333200 0 2 6 8 569 994;3033;4074;4136;5925;6789;7132;7773;8757;11003;11392;11396;12502;13179 False;True;False;True;False;False;False;False;True;False;True;False;True;True 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12483;20004;23831;28444;31920 P19388 P19388 2 2 2 DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 POLR2E sp|P19388|RPAB1_HUMAN DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=POLR2E PE=1 SV=4 1 2 2 2 0 1 2 0 1 2 0 1 2 14.8 14.8 14.8 24.551 210 210 7 5 0 28.193 By MS/MS By MS/MS 0 6.7 14.8 71489000 0 20209000 51280000 0 0 8011800 0 2 3 5 607 784;5224 True;True 817;818;5438 3351;3352;3353;3354;21898 2747;2748;2749;18406;18407 2749;18406 265 110 P19404 P19404 1 1 1 NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 2, mitochondrial NDUFV2 sp|P19404|NDUV2_HUMAN NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 2, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NDUFV2 PE=1 SV=2 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 5.2 5.2 5.2 27.391 249 249 7 2 0.0066108 6.2031 By matching By MS/MS 0 5.2 5.2 5416800 0 1680800 3736100 0 0 662940 0 0 1 1 608 37 True 38 107;108 80 80 P19525 P19525 14 14 14 Interferon-induced, double-stranded RNA-activated protein kinase EIF2AK2 sp|P19525|E2AK2_HUMAN Interferon-induced, double-stranded RNA-activated protein kinase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EIF2AK2 PE=1 SV=2 1 14 14 14 2 9 12 2 9 12 2 9 12 30.1 30.1 30.1 62.094 551 551 3.57 2 3 23 10 3 3 2 0 111.89 By matching By MS/MS By MS/MS 4 21.1 29.8 385590000 2976700 93724000 288890000 5490300 18733000 70846000 0 16 15 31 609 453;1455;1949;2792;3552;5911;6805;7133;7526;7543;14554;15827;15886;15887 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 471;1526;2031;2909;3699;6157;7094;7428;7835;7853;15284;16586;16649;16650 1859;1860;6481;6482;6483;8342;8343;8344;8345;11640;11641;11642;11643;11644;14535;24930;24931;24932;24933;24934;24935;24936;29000;29001;30344;30345;30346;32053;32054;32055;32056;32057;32158;32159;32160;32161;32162;32163;64029;69174;69175;69176;69450;69451;69452;69453 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P19784 P19784 3 3 3 Casein kinase II subunit alpha CSNK2A2 sp|P19784|CSK22_HUMAN Casein kinase II subunit alpha OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CSNK2A2 PE=1 SV=1 1 3 3 3 0 1 3 0 1 3 0 1 3 8.9 8.9 8.9 41.213 350 350 5 2 4 2 0 17.987 By MS/MS By MS/MS 0 2.3 8.9 36458000 0 5079000 31379000 0 0 4456400 0 1 3 4 612 2305;4132;15366 True;True;True 2407;4305;16114 9787;9788;9789;16950;16951;16952;16953;67269 8003;14025;14026;56738 8003;14025;56738 P20042 P20042 12 12 12 Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit 2 EIF2S2 sp|P20042|IF2B_HUMAN Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EIF2S2 PE=1 SV=2 1 12 12 12 1 6 10 1 6 10 1 6 10 41.4 41.4 41.4 38.388 333 333 4.96 1 2 10 22 5 5 0 270.26 By matching By MS/MS By MS/MS 3 18 34.2 629320000 3435600 80166000 545720000 0 36068000 62119000 0 9 18 27 613 1616;2386;2873;3365;4084;5840;5864;6892;10938;11906;12407;13121 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 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16 14 rRNA 2-O-methyltransferase fibrillarin FBL sp|P22087|FBRL_HUMAN rRNA 2-O-methyltransferase fibrillarin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FBL PE=1 SV=2 1 16 16 14 6 11 15 6 11 15 4 10 13 55.1 55.1 51.7 33.784 321 321 5.09 7 6 6 12 24 45 9 1 1 2 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 23.1 36.1 52.3 2835600000 74380000 487100000 2274100000 85689000 241690000 263460000 2 18 60 80 627 960;1758;4621;5283;6642;7101;7350;7351;9802;10077;10331;10332;10597;11631;14801;15087 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1011;1837;4820;5499;6925;7395;7650;7651;10285;10286;10606;10875;10876;11165;12235;15538;15829 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4 4 Eukaryotic translation initiation factor 4B EIF4B sp|P23588|IF4B_HUMAN Eukaryotic translation initiation factor 4B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EIF4B PE=1 SV=2 1 4 4 4 2 3 4 2 3 4 2 3 4 8.5 8.5 8.5 69.15 611 611 3.5 1 3 7 3 1 3 0 26.375 By matching By MS/MS By MS/MS 3.9 6.4 8.5 555450000 14642000 168300000 372500000 34658000 60306000 62716000 0 4 4 8 646 149;4715;14014;14141 True;True;True;True 152;4915;14723;14852 561;562;563;564;565;566;19905;19906;19907;19908;19909;19910;19911;61575;62204;62205;62206;62207 471;472;16712;16713;16714;51853;52523;52524 472;16713;51853;52524 P23919 P23919 1 1 1 Thymidylate kinase DTYMK sp|P23919|KTHY_HUMAN Thymidylate kinase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DTYMK PE=1 SV=4 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 5.7 5.7 5.7 23.819 212 212 7 1 0.0078878 6.15 By MS/MS 0 0 5.7 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 647 15504 True 16254 67734 57105 57105 P24468;P10589 P24468;P10589 3;2 3;2 3;2 COUP transcription factor 2;COUP transcription factor 1 NR2F2;NR2F1 sp|P24468|COT2_HUMAN COUP 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Mitogen-activated protein kinase 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MAPK3 PE=1 SV=4;sp|P31152|MK04_HUMAN Mitogen-activated protein kinase 4 OS 4 2 2 2 0 2 1 0 2 1 0 2 1 6.7 6.7 6.7 41.389 360 360;379;587;721 4.83 1 1 1 3 0 14.41 By MS/MS By MS/MS 0 6.7 3.9 16206000 0 9445000 6760700 0 3411600 0 0 2 2 4 694 3;15713 True;True 3;16470 16;17;18;19;20;68676 9;10;11;57887 11;57887 Q9IWW8;P28887 Q9IWW8;P28887 1;1 1;1 1;1 sp|Q9IWW8|L_HRSVL RNA-directed RNA polymerase L OS=Human respiratory syncytial virus A (strain Long) OX=11260 GN=L PE=3 SV=1;sp|P28887|L_HRSVA RNA-directed RNA polymerase L OS=Human respiratory syncytial virus A (strain A2) OX=11259 GN=L PE=1 SV=1 2 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0.5 0.5 0.5 250.59 2165 2165;2165 3 1 0.0091583 6.1017 By MS/MS 0 0 0.5 19954000 0 0 19954000 0 0 3870100 0 0 1 1 695 614 True 637 2543 2080 2080 P29083 P29083 2 2 2 General transcription factor IIE subunit 1 GTF2E1 sp|P29083|T2EA_HUMAN General transcription factor IIE subunit 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GTF2E1 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P30043 P30043 1 1 1 Flavin reductase (NADPH) BLVRB sp|P30043|BLVRB_HUMAN Flavin reductase (NADPH) OS=Homo sapiens OX=9606 GN=BLVRB PE=1 SV=3 1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 7.3 7.3 7.3 22.119 206 206 7 2 0.00098377 7.3961 By matching By MS/MS 7.3 0 7.3 9262600 520070 0 8742500 0 0 1551300 0 0 1 1 706 13780 True 14481 60276;60277 50488 50488 P30048 P30048 4 4 4 Thioredoxin-dependent peroxide reductase, mitochondrial PRDX3 sp|P30048|PRDX3_HUMAN Thioredoxin-dependent peroxide reductase, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PRDX3 PE=1 SV=3 1 4 4 4 1 3 3 1 3 3 1 3 3 17.2 17.2 17.2 27.692 256 256 6.33 1 1 3 7 0 26.575 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 4.7 14.5 12.9 120700000 2413700 20944000 97338000 0 3862500 24901000 1 3 3 7 707 2372;4677;5456;12749 True;True;True;True 2476;4876;5680;13408 10049;10050;10051;19785;19786;19787;19788;19789;19790;22848;22849;55494 8190;16630;16631;16632;19248;19249;46402 8190;16631;19248;46402 P30050 P30050 5 5 5 60S ribosomal protein L12 RPL12 sp|P30050|RL12_HUMAN 60S ribosomal protein L12 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RPL12 PE=1 SV=1 1 5 5 5 5 4 5 5 4 5 5 4 5 45.5 45.5 45.5 17.818 165 165 7.7 4 14 19 3 3 0 301.84 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 45.5 33.9 45.5 1838400000 130330000 760340000 947700000 103550000 405360000 235710000 6 15 17 38 708 2824;5507;5568;5954;10818 True;True;True;True;True 2941;5735;5798;6201;11395 11785;11786;11787;11788;11789;23110;23111;23112;23113;23114;23115;23394;23395;23396;23397;23398;23399;23400;23401;23402;25131;25132;25133;25134;25135;25136;25137;25138;25139;46834;46835;46836;46837;46838;46839;46840;46841;46842;46843;46844;46845;46846;46847 9638;9639;9640;9641;9642;19458;19459;19460;19461;19462;19752;19753;19754;19755;19756;19757;19758;19759;19760;19761;21163;21164;21165;21166;21167;21168;21169;21170;39028;39029;39030;39031;39032;39033;39034;39035;39036;39037;39038;39039;39040 9641;19461;19759;21164;39032 P30084 P30084 2 2 2 Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial ECHS1 sp|P30084|ECHM_HUMAN Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ECHS1 PE=1 SV=4 1 2 2 2 1 2 2 1 2 2 1 2 2 11.7 11.7 11.7 31.387 290 290 6.9 1 9 0 24.13 By matching By MS/MS By MS/MS 7.2 11.7 11.7 57761000 549820 11274000 45937000 0 7008400 7494200 0 1 5 6 709 1080;10383 True;True 1137;10937 4667;4668;4669;4670;4671;4672;44924;44925;44926;44927 3877;3878;3879;3880;37396;37397 3880;37396 P30086 P30086 5 5 5 Phosphatidylethanolamine-binding protein 1;Hippocampal cholinergic neurostimulating peptide PEBP1 sp|P30086|PEBP1_HUMAN Phosphatidylethanolamine-binding protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PEBP1 PE=1 SV=3 1 5 5 5 3 2 3 3 2 3 3 2 3 34.8 34.8 34.8 21.057 187 187 7.57 1 8 1 4 0 111.24 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 19.3 18.7 26.2 45238000 10116000 5535400 29586000 0 4220700 5514500 5 1 4 10 710 4799;9376;9421;10479;14769 True;True;True;True;True 5002;9751;9796;11038;15505 20239;20240;20241;20242;20243;20244;20245;39785;39922;45374;45375;45376;45377;64843 16979;16980;16981;16982;16983;33162;33267;37760;37761;54669 16980;33162;33267;37760;54669 P30101 P30101 9 9 9 Protein disulfide-isomerase A3 PDIA3 sp|P30101|PDIA3_HUMAN Protein disulfide-isomerase A3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PDIA3 PE=1 SV=4 1 9 9 9 2 3 9 2 3 9 2 3 9 23 23 23 56.782 505 505 3.83 4 13 1 0 313.05 By matching By MS/MS By MS/MS 4.4 6.5 23 146070000 9865900 15120000 121090000 10812000 8136500 15772000 0 3 9 12 711 1721;3031;3808;4085;4399;8565;9479;11831;13096 True;True;True;True;True;True;True;True;True 1796;3155;3965;4257;4587;8917;9867;12448;13768 7533;12546;15706;15707;15708;16806;16807;16808;18104;18105;36734;36735;40196;40197;51099;51100;56880;56881 6268;10244;12906;12907;13922;13923;14977;14978;30825;33483;42479;47509 6268;10244;12906;13923;14977;30825;33483;42479;47509 P30153;P30154 P30153 10;2 10;2 10;2 Serine/threonine-protein phosphatase 2A 65 kDa regulatory subunit A alpha isoform PPP2R1A sp|P30153|2AAA_HUMAN Serine/threonine-protein phosphatase 2A 65 kDa regulatory subunit A alpha isoform OS=Homo sapiens OX=9606 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LCN1 sp|P31025|LCN1_HUMAN Lipocalin-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=LCN1 PE=1 SV=1 2 10 10 10 10 2 3 10 2 3 10 2 3 61.4 61.4 61.4 19.25 176 176;162 6.27 7 6 8 9 11 10 11 17 16 12 0 160.77 By MS/MS By matching By matching 61.4 10.8 25.6 17660000000 17633000000 14785000 11713000 19616000000 91353000 98304000 96 0 0 96 716 954;1415;1768;1769;2669;4745;5615;10369;12004;15192 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1001;1002;1482;1848;1849;2783;2784;4945;5850;10923;12632;15935;15936 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T-cell leukemia homeobox protein 1 TLX1 sp|P31314|TLX1_HUMAN T-cell leukemia homeobox protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TLX1 PE=1 SV=1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 3.6 3.6 3.6 34.364 330 330 6 2 0.001004 7.5826 By MS/MS By MS/MS 0 3.6 3.6 3473300 0 0 3473300 0 0 519640 0 1 1 2 719 6190 True 6449 26362;26363 22287;22288 22288 P31689 P31689 8 8 8 DnaJ homolog subfamily A member 1 DNAJA1 sp|P31689|DNJA1_HUMAN DnaJ homolog subfamily A member 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DNAJA1 PE=1 SV=2 1 8 8 8 0 6 6 0 6 6 0 6 6 29.7 29.7 29.7 44.868 397 397 4.93 1 7 16 2 1 1 0 74.072 By MS/MS By MS/MS 0 21.2 23.7 402780000 0 83250000 319530000 0 28492000 39846000 0 8 12 20 720 3063;3332;5659;10631;10967;13259;14852;15679 True;True;True;True;True;True;True;True 3187;3467;5896;11201;11548;13935;15592;16433 12671;13628;23877;23878;23879;23880;46097;46098;46099;46100;47506;47507;47508;57618;57619;57620;57621;57622;57623;57624;57625;57626;57627;57628;57629;65183;68514;68515 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P35527;CON__P35527 46;45 46;45 45;44 Keratin, type I cytoskeletal 9 KRT9 sp|P35527|K1C9_HUMAN Keratin, type I cytoskeletal 9 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KRT9 PE=1 SV=3; 2 46 46 45 45 26 36 45 26 36 44 25 35 75 75 75 62.064 623 623;623 5.29 141 107 146 152 125 106 101 128 139 87 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 71.3 56.7 67.9 91106000000 63950000000 1976100000 25180000000 53885000000 1844000000 11835000000 812 148 448 1408 + 750 1781;2125;2626;2797;3585;4009;4011;4454;4498;4499;4500;5353;5354;5355;5946;5947;6091;6406;6407;6822;7111;7509;7510;7690;9812;9859;10105;10106;10658;10659;10853;10879;10894;10922;11231;11747;11748;11931;11932;12710;13365;13389;14972;14973;14974;15532 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 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glycosyltransferase 48 kDa subunit DDOST sp|P39656|OST48_HUMAN Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase 48 kDa subunit OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DDOST PE=1 SV=4 1 6 6 6 1 5 4 1 5 4 1 5 4 14 14 14 50.8 456 456 4.9 1 9 0 43.947 By matching By MS/MS By MS/MS 2.4 11.6 8.3 85531000 2521700 39901000 43107000 0 7895700 8402400 0 5 4 9 779 4352;8621;10546;12617;13447;15953 True;True;True;True;True;True 4535;8978;11110;13275;14130;16717 17868;17869;36973;36974;45649;54868;54869;58683;58684;69703 14784;14785;30997;37984;45847;45848;49122;49123;58725 14785;30997;37984;45848;49123;58725 P39748 P39748 12 12 12 Flap endonuclease 1 FEN1 sp|P39748|FEN1_HUMAN Flap endonuclease 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FEN1 PE=1 SV=1 1 12 12 12 1 7 10 1 7 10 1 7 10 37.6 37.6 37.6 42.592 380 380 5 3 2 3 11 21 7 7 1 2 0 157.18 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 2.9 21.6 30.3 1058300000 7938900 191920000 858460000 0 76902000 138940000 1 14 26 41 780 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mitochondrial;Long-chain enoyl-CoA hydratase;Long chain 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase HADHA sp|P40939|ECHA_HUMAN Trifunctional enzyme subunit alpha, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HADHA PE=1 SV=2 1 11 11 11 4 6 8 4 6 8 4 6 8 22.4 22.4 22.4 82.999 763 763 2.96 1 24 0 142.18 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 6.3 10.9 18.2 186490000 4672500 58778000 123040000 8228500 21183000 23154000 1 11 11 23 789 1737;4064;5402;6228;7025;9084;9610;9882;13416;13839;14451 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1814;4235;5624;6489;7317;9452;10040;10397;10398;14098;14540;15174 7581;16732;22627;26509;29931;38667;38668;38669;40837;42293;42294;42295;42296;42297;42298;42299;58553;60680;60681;60682;60683;63569;63570;63571;63572 6305;13869;19027;22399;25308;32363;32364;34016;35181;35182;35183;35184;35185;35186;49004;51012;51013;51014;51015;51016;53678;53679;53680 6305;13869;19027;22399;25308;32364;34016;35185;49004;51016;53680 391 191 P41091;Q2VIR3 P41091;Q2VIR3 16;14 16;14 16;14 Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit 3;Putative eukaryotic translation initiation factor 2 subunit 3-like protein EIF2S3;EIF2S3L sp|P41091|IF2G_HUMAN Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EIF2S3 PE=1 SV=3;sp|Q2VIR3|IF2GL_HUMAN Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit 3B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EIF2S3B PE=2 SV=2 2 16 16 16 3 12 14 3 12 14 3 12 14 40.5 40.5 40.5 51.109 472 472;472 4.81 4 5 15 38 22 16 6 4 4 4 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 7.4 32.8 38.8 3546200000 15845000 1438800000 2091600000 17290000 494410000 419540000 1 42 41 84 790 469;634;3740;5158;5376;6686;6698;8053;8990;9145;10028;10824;10836;11725;12736;14375 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 487;659;3896;5371;5596;6972;6985;8387;9356;9518;10556;10557;11401;11414;12334;13395;15094 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sp|P41214|EIF2D_HUMAN Eukaryotic translation initiation factor 2D OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EIF2D PE=1 SV=3 1 2 2 2 0 1 1 0 1 1 0 1 1 5.7 5.7 5.7 64.706 584 584 3 2 0 13.272 By MS/MS By MS/MS 0 3.6 2.1 6177600 0 1355500 4822100 0 577850 0 0 1 1 2 792 1045;12259 True;True 1100;12899 4556;53309 3788;44572 3788;44572 P41223 P41223 3 3 3 Protein BUD31 homolog BUD31 sp|P41223|BUD31_HUMAN Protein BUD31 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=BUD31 PE=1 SV=2 1 3 3 3 0 3 3 0 3 3 0 3 3 20.8 20.8 20.8 17 144 144 7.6 1 2 7 0 38.072 By MS/MS By MS/MS 0 20.8 20.8 50848000 0 10461000 40387000 0 5117200 5861200 0 2 4 6 793 6790;7293;14220 True;True;True 7078;7593;14935 28934;28935;28936;31017;31018;31019;31020;62505;62506;62507 24492;26172;26173;26174;26175;52775;52776 24492;26174;52776 P41227;Q9BSU3 P41227 3;1 3;1 3;1 N-alpha-acetyltransferase 10 NAA10 sp|P41227|NAA10_HUMAN N-alpha-acetyltransferase 10 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NAA10 PE=1 SV=1 2 3 3 3 1 2 2 1 2 2 1 2 2 14 14 14 26.458 235 235;229 6.17 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dehydrogenase [NADP], mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=IDH2 PE=1 SV=2;sp|O75874|IDHC_HUMAN Isocitrate dehydrogenase [NADP] cytoplasmic OS=Homo sapiens OX=9606 GN=IDH1 PE=1 SV=2 2 2 2 2 0 0 2 0 0 2 0 0 2 4 4 4 50.909 452 452;414 5 2 0 13.507 By MS/MS 0 0 4 5826800 0 0 5826800 0 0 812730 0 0 2 2 849 10146;15592 True;True 10683;16344 43545;68189 36225;57510 36225;57510 P49207 P49207 2 2 2 60S ribosomal protein L34 RPL34 sp|P49207|RL34_HUMAN 60S ribosomal protein L34 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RPL34 PE=1 SV=3 1 2 2 2 0 2 2 0 2 2 0 2 2 7.7 7.7 7.7 13.293 117 117 7.38 1 1 2 3 1 0 14.735 By MS/MS By MS/MS 0 7.7 7.7 383890000 0 337560000 46330000 0 1352300000 101500000 0 3 2 5 850 417;11278 True;True 432;11865 1701;1702;1703;1704;1705;1706;48773;48774 1368;1369;1370;1371;40636 1369;40636 P49247 P49247 1 1 1 Ribose-5-phosphate isomerase RPIA sp|P49247|RPIA_HUMAN Ribose-5-phosphate isomerase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RPIA PE=1 SV=3 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 5.1 5.1 5.1 33.269 311 311 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MS/MS By MS/MS 1.6 5.3 9.6 136710000 10017000 33506000 93183000 13734000 18979000 13554000 1 10 14 25 853 762;1141;2256;2526;3533;3907;6357;7999;8624;8873;9535;12229;12306;13162;14590;15129;15253;15335;15929 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 795;1198;2355;2636;3676;4070;6628;8331;8981;9239;9937;12867;12946;13836;15322;15871;16000;16082;16693 3269;3270;4930;9573;9574;10668;10669;14460;14461;16075;16076;27040;34140;34141;34142;36977;36978;36979;37850;37851;40388;53142;53143;53539;53540;57122;64217;66254;66255;66256;66816;67173;69635;69636;69637 2693;2694;4071;7844;8688;11867;13278;22861;28704;28705;28706;31000;31001;31702;33638;44396;44397;44768;47684;54179;55808;56356;56634;58679;58680 2694;4071;7844;8688;11867;13278;22861;28706;31000;31702;33638;44397;44768;47684;54179;55808;56356;56634;58679 P49368 P49368 9 9 9 T-complex protein 1 subunit gamma CCT3 sp|P49368|TCPG_HUMAN T-complex protein 1 subunit gamma OS=Homo sapiens 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multifunctional enzyme type 2;(3R)-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase;Enoyl-CoA hydratase 2 HSD17B4 sp|P51659|DHB4_HUMAN Peroxisomal multifunctional enzyme type 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HSD17B4 PE=1 SV=3 1 6 6 6 0 4 3 0 4 3 0 4 3 12.6 12.6 12.6 79.685 736 736 4.5 5 2 1 0 77.027 By MS/MS By MS/MS 0 9.2 5.4 29625000 0 15544000 14081000 0 6795900 0 0 5 3 8 898 1363;4207;5792;7925;14049;14734 True;True;True;True;True;True 1427;4381;6032;8253;14758;15469 5986;17240;24405;24406;33842;33843;61784;64711 4956;14251;20603;20604;28454;28455;52169;54577 4956;14251;20603;28455;52169;54577 P51858 P51858 6 5 5 Hepatoma-derived growth factor HDGF sp|P51858|HDGF_HUMAN Hepatoma-derived growth factor OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HDGF PE=1 SV=1 1 6 5 5 0 2 6 0 1 5 0 1 5 25.8 22.5 22.5 26.788 240 240 5.62 1 5 5 2 0 37.116 By matching By MS/MS 0 10 25.8 84999000 0 2159300 82840000 0 0 12319000 0 0 8 8 899 1926;2406;4405;5228;6916;11280 True;True;True;False;True;True 2008;2512;4593;5442;7207;11867 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P53618 4 4 4 Coatomer subunit beta COPB1 sp|P53618|COPB_HUMAN Coatomer subunit beta OS=Homo sapiens OX=9606 GN=COPB1 PE=1 SV=3 1 4 4 4 0 3 3 0 3 3 0 3 3 7.2 7.2 7.2 107.14 953 953 3.57 4 1 2 0 39.444 By MS/MS By MS/MS 0 5.4 5 18085000 0 5411100 12674000 0 2206500 2955100 0 2 4 6 921 9224;9329;10630;14726 True;True;True;True 9598;9704;11200;15460 39217;39218;39613;46096;64681;64682;64683 32739;33048;38388;54552;54553;54554 32739;33048;38388;54553 P53621 P53621 16 16 16 Coatomer subunit alpha;Xenin;Proxenin COPA sp|P53621|COPA_HUMAN Coatomer subunit alpha OS=Homo sapiens OX=9606 GN=COPA PE=1 SV=2 1 16 16 16 2 15 5 2 15 5 2 15 5 16.7 16.7 16.7 138.34 1224 1224 2.03 4 22 3 1 0 105.38 By matching By MS/MS By MS/MS 1.3 15.6 5.3 112910000 5431100 89820000 17654000 9187300 38303000 3448900 0 17 3 20 922 1229;1562;1563;5142;7329;8252;8308;8424;8959;9245;12049;12598;12907;13317;15215;15349 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 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MS/MS By MS/MS 3 5.7 8 64915000 941600 13163000 50810000 0 0 9672800 0 2 5 7 937 1702;6493;11100;11101;12788 True;True;True;True;True 1776;6769;11684;11685;13449 7462;7463;7464;7465;27615;48021;48022;48023;55644 6212;6213;6214;23344;40041;40042;40043;46523 6213;23344;40042;40043;46523 P55084 P55084 8 8 8 Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial;3-ketoacyl-CoA thiolase HADHB sp|P55084|ECHB_HUMAN Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HADHB PE=1 SV=3 1 8 8 8 1 4 7 1 4 7 1 4 7 22.6 22.6 22.6 51.294 474 474 4.47 1 8 10 0 60.712 By matching By MS/MS By MS/MS 5.5 8.6 20.5 126630000 2951000 19639000 104040000 0 8668200 12352000 0 4 9 13 938 117;935;1696;2127;3874;6793;10633;13550 True;True;True;True;True;True;True;True 119;976;1770;2222;4035;7081;11203;14240 419;420;421;3939;3940;7444;9069;9070;9071;15920;15921;15922;28940;28941;28942;46103;46104;46105;59192 343;344;345;3228;6196;7477;7478;13070;13071;24496;38393;38394;49541 345;3228;6196;7478;13070;24496;38393;49541 P55201 P55201 1 1 1 Peregrin BRPF1 sp|P55201|BRPF1_HUMAN Peregrin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=BRPF1 PE=1 SV=2 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 1.9 1.9 1.9 137.5 1214 1214 1.5 1 1 0.0010267 8.1043 By MS/MS 0 0 1.9 3709700 0 0 3709700 0 0 816140 0 0 1 1 939 2233 True 2332 9501;9502 7790 7790 P55209 P55209 8 8 7 Nucleosome assembly protein 1-like 1 NAP1L1 sp|P55209|NP1L1_HUMAN Nucleosome assembly protein 1-like 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NAP1L1 PE=1 SV=1 1 8 8 7 3 5 8 3 5 8 2 5 7 22.5 22.5 19.9 45.374 391 391 4.69 2 2 3 20 10 7 5 1 1 0 180.89 By matching By MS/MS By MS/MS 10.2 19.7 22.5 717650000 7327100 50462000 659860000 11476000 21680000 91340000 0 7 25 32 940 4120;4577;7327;7579;10570;11051;15527;15528 True;True;True;True;True;True;True;True 4292;4774;7627;7890;11136;11137;11633;16278;16279 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4681;6942;16728;19926;30561;34538;46178;53567;55897;57562 454 315 P55809 P55809 1 1 1 Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial OXCT1 sp|P55809|SCOT1_HUMAN Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=OXCT1 PE=1 SV=1 1 1 1 1 0 1 0 0 1 0 0 1 0 4 4 4 56.157 520 520 4 1 0 11.26 By MS/MS 0 4 0 960710 0 960710 0 0 318820 0 0 1 0 1 945 4747 True 4947 20038 16828 16828 Q6EEV6;P61956;P55854 Q6EEV6;P61956;P55854 1;1;1 1;1;1 1;1;1 Small ubiquitin-related modifier 4;Small ubiquitin-related modifier 2;Small ubiquitin-related modifier 3 SUMO4;SUMO2;SUMO3 sp|Q6EEV6|SUMO4_HUMAN Small ubiquitin-related modifier 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SUMO4 PE=1 SV=2;sp|P61956|SUMO2_HUMAN Small ubiquitin-related modifier 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SUMO2 PE=1 SV=3;sp|P55854|SUMO3_HUMAN Small ubiquitin-related modifier 3 3 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 12.6 12.6 12.6 10.685 95 95;95;103 8.25 3 1 0.0010471 9.2468 By MS/MS By MS/MS By matching 12.6 12.6 12.6 29205000 0 6247700 22958000 0 0 4236600 1 1 0 2 946 13987 True 14695 61482;61483;61484;61485 51774;51775 51775 P55884 P55884 3 3 3 Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B EIF3B sp|P55884|EIF3B_HUMAN Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EIF3B PE=1 SV=3 1 3 3 3 0 2 2 0 2 2 0 2 2 4.4 4.4 4.4 92.48 814 814 2.88 4 2 1 1 0 34.351 By MS/MS By MS/MS 0 2.8 2.7 26452000 0 11497000 14954000 0 4976500 0 0 3 2 5 947 1064;14117;15187 True;True;True 1121;14828;15930 4630;62085;62086;66517;66518;66519;66520;66521 3845;52425;56112;56113;56114 3845;52425;56112 P56182 P56182 11 11 11 Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A RRP1 sp|P56182|RRP1_HUMAN Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RRP1 PE=1 SV=1 1 11 11 11 1 6 10 1 6 10 1 6 10 28.2 28.2 28.2 52.839 461 461 4.03 1 5 18 6 1 0 90.713 By matching By MS/MS By MS/MS 2.6 15 26.5 245940000 4249500 109140000 132550000 0 34409000 23375000 0 10 11 21 948 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927;1539;3762;4608;4870;5334;5562;6901;10957 3743;3744;3745;6533;14793;18264;18265;19752;19753;21523;22326;28233;28234;28235;28236;44996 3029;3030;5435;12119;15120;15121;16620;18119;18767;23949;23950;37451 3030;5435;12119;15120;16620;18119;18767;23949;37451 P56385 P56385 2 2 2 ATP synthase subunit e, mitochondrial ATP5I sp|P56385|ATP5I_HUMAN ATP synthase subunit e, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ATP5ME PE=1 SV=2 1 2 2 2 0 1 2 0 1 2 0 1 2 26.1 26.1 26.1 7.9331 69 69 10 3 0 11.424 By MS/MS By MS/MS 0 15.9 26.1 7615100 0 1499900 6115200 0 0 13374000 0 1 2 3 950 14939;15854 True;True 15680;16616 65518;65519;69299 55241;55242;58387 55242;58387 P56537 P56537 4 4 4 Eukaryotic translation initiation factor 6 EIF6 sp|P56537|IF6_HUMAN Eukaryotic translation initiation factor 6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EIF6 PE=1 SV=1 1 4 4 4 3 4 4 3 4 4 3 4 4 21.6 21.6 21.6 26.599 245 245 6.06 1 1 1 4 11 0 78.778 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 15.9 21.6 21.6 692230000 108060000 190660000 393510000 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DAD1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DAD1 PE=1 SV=3 1 3 3 3 1 3 3 1 3 3 1 3 3 28.3 28.3 28.3 12.497 113 113 9.8 2 8 0 43.594 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 8.8 28.3 28.3 100580000 1576400 24147000 74858000 0 87670000 180110000 1 3 6 10 998 209;3759;11716 True;True;True 213;3915;12324;12325 777;778;779;15447;15448;50515;50516;50517;50518;50519 630;631;632;12652;12653;41976;41977;41978;41979;41980 632;12653;41977 P61960 P61960 1 1 1 Ubiquitin-fold modifier 1 UFM1 sp|P61960|UFM1_HUMAN Ubiquitin-fold modifier 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UFM1 PE=1 SV=1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 17.6 17.6 17.6 9.1175 85 85 10 2 0.0062222 6.2461 By MS/MS By MS/MS 0 17.6 17.6 7504000 0 3507400 3996600 0 0 8741000 0 1 1 2 999 14759 True 15495 64816;64817 54651;54652 54652 P61962 P61962 2 2 2 DDB1- and CUL4-associated factor 7 DCAF7 sp|P61962|DCAF7_HUMAN DDB1- and CUL4-associated factor 7 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DCAF7 PE=1 SV=1 1 2 2 2 0 1 2 0 1 2 0 1 2 9.9 9.9 9.9 38.926 342 342 5.8 2 2 1 0 13.841 By MS/MS By MS/MS 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109 P62304 P62304 4 4 4 Small nuclear ribonucleoprotein E SNRPE sp|P62304|RUXE_HUMAN Small nuclear ribonucleoprotein E OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SNRPE PE=1 SV=1 1 4 4 4 2 4 2 2 4 2 2 4 2 32.6 32.6 32.6 10.803 92 92 8.16 3 3 2 6 11 0 36.45 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 25 32.6 25 2251200000 150830000 674620000 1425800000 152220000 3034700000 849150000 5 12 14 31 1018 4266;6288;14841;15005 True;True;True;True 4445;6555;15580;15581;15746 17529;17530;17531;17532;17533;17534;17535;17536;17537;17538;26784;65143;65144;65145;65146;65147;65148;65149;65150;65151;65152;65153;65154;65155;65836 14505;14506;14507;14508;14509;14510;14511;14512;22616;54914;54915;54916;54917;54918;54919;54920;54921;54922;54923;54924;54925;54926;54927;54928;54929;54930;54931;54932;54933;54934;55510 14507;22616;54934;55510 486 14 P62306 P62306 6 6 6 Small nuclear ribonucleoprotein F SNRPF sp|P62306|RUXF_HUMAN Small nuclear ribonucleoprotein F OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SNRPF PE=1 SV=1 1 6 6 6 2 4 6 2 4 6 2 4 6 48.8 48.8 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RPABC5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=POLR2L PE=1 SV=1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 13.4 13.4 13.4 7.645 67 67 10 2 0.0024213 7.194 By MS/MS By MS/MS 0 13.4 13.4 104770000 0 25372000 79402000 0 0 173660000 0 1 1 2 1044 8391 True 8733 35917;35918 30153;30154 30153 P62877 P62877 2 2 2 E3 ubiquitin-protein ligase RBX1;E3 ubiquitin-protein ligase RBX1, N-terminally processed RBX1 sp|P62877|RBX1_HUMAN E3 ubiquitin-protein ligase RBX1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RBX1 PE=1 SV=1 1 2 2 2 0 2 1 0 2 1 0 2 1 17.6 17.6 17.6 12.274 108 108 9 4 0 20.816 By MS/MS By MS/MS 0 17.6 17.6 9310900 0 5805100 3505900 0 3780400 0 0 3 1 4 1045 25;26 True;True 25;26;27 76;77;78;79 55;56;57;58 55;58 501 5 P62888 P62888 7 7 7 60S ribosomal protein L30 RPL30 sp|P62888|RL30_HUMAN 60S ribosomal protein L30 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RPL30 PE=1 SV=2 1 7 7 7 2 5 5 2 5 5 2 5 5 66.1 66.1 66.1 12.784 115 115 8.45 1 15 12 1 0 95.932 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 30.4 35.7 51.3 500730000 18222000 61781000 420730000 41334000 22433000 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P63244 P63244 13 13 13 Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-2-like 1;Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-2-like 1, N-terminally processed GNB2L1 sp|P63244|RACK1_HUMAN Receptor of activated protein C kinase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RACK1 PE=1 SV=3 1 13 13 13 5 10 11 5 10 11 5 10 11 45.7 45.7 45.7 35.076 317 317 6.12 2 3 4 29 7 1 4 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 17.7 35.3 42.6 988800000 31518000 309490000 647800000 62566000 96399000 108250000 1 14 18 33 1068 1674;1739;2312;3996;4523;6077;6078;6708;9165;9347;13051;15362;15983 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1747;1816;2414;4163;4717;4718;6333;6334;6995;9538;9722;13722;16110;16747 7341;7342;7343;7344;7345;7583;7584;7585;9798;9799;9800;16419;16420;16421;19106;19107;19108;19109;19110;19111;25835;25836;25837;25838;25839;25840;25841;25842;25843;28627;28628;28629;38978;38979;39683;39684;39685;39686;39687;39688;39689;56753;67250;67251;67252;67253;67254;67255;67256;69792 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P79522 P79522 1 1 1 Proline-rich protein 3 PRR3 sp|P79522|PRR3_HUMAN Proline-rich protein 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PRR3 PE=1 SV=2 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 9 9 9 20.64 188 188 7 1 0.0095735 6.0889 By MS/MS 0 0 9 660190 0 0 660190 0 0 117150 0 0 1 1 1091 4865 True 5069 20462 17167 17167 P80188 P80188 1 1 1 Neutrophil gelatinase-associated lipocalin LCN2 sp|P80188|NGAL_HUMAN Neutrophil gelatinase-associated lipocalin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=LCN2 PE=1 SV=2 1 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 7.6 7.6 7.6 22.588 198 198 9.5 1 1 0 49.536 By MS/MS 7.6 0 0 6168600 6168600 0 0 5962400 0 0 2 0 0 2 1092 14924 True 15665 65438;65439 55146;55147 55146 P80723 P80723 3 3 3 Brain acid soluble protein 1 BASP1 sp|P80723|BASP1_HUMAN Brain acid soluble protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=BASP1 PE=1 SV=2 1 3 3 3 0 0 3 0 0 3 0 0 3 29.1 29.1 29.1 22.693 227 227 3.75 1 3 0 31.049 By MS/MS 0 0 29.1 26751000 0 0 26751000 0 0 4485500 0 0 3 3 1093 50;346;3317 True;True;True 51;360;3452 148;1425;1426;13582 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Q08188 Q08188 14 14 14 Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E;Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E 50 kDa catalytic chain;Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E 27 kDa non-catalytic chain TGM3 sp|Q08188|TGM3_HUMAN Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TGM3 PE=1 SV=4 1 14 14 14 14 1 3 14 1 3 14 1 3 24.2 24.2 24.2 76.631 693 693 6.32 10 2 4 5 8 4 7 10 11 13 0 126.12 By MS/MS By matching By MS/MS 24.2 1.6 4.6 387360000 327460000 1001000 58899000 302010000 0 91547000 37 0 6 43 1181 107;1557;1792;2166;3390;4007;4933;5791;6572;6633;7675;10808;14500;14897 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 109;1629;1873;2262;3528;4175;5139;6031;6852;6915;7990;11385;15227;15638 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By matching By MS/MS By MS/MS 3 5.2 13 120170000 5686600 16139000 98341000 5398700 8350000 19406000 0 3 11 14 1189 976;5856;7841;8393;8825;9119;10109;10244;10652;14816 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1027;6098;8165;8735;9189;9490;10645;10784;11222;15554 4226;24707;24708;24709;24710;24711;33459;33460;33461;35923;37705;37706;38787;38788;38789;38790;38791;43411;44196;46183;65078;65079;65080 3513;20843;20844;28146;28147;30157;31584;31585;32452;36121;36803;38452;54864;54865 3513;20844;28147;30157;31584;32452;36121;36803;38452;54865 Q09666 Q09666 13 13 13 Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK AHNAK sp|Q09666|AHNK_HUMAN Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AHNAK PE=1 SV=2 1 13 13 13 1 8 7 1 8 7 1 8 7 10.6 10.6 10.6 629.09 5890 5890 1.57 14 6 2 1 0 80.093 By matching By MS/MS By MS/MS 2.1 5.6 7.4 96722000 4224200 34689000 57809000 0 20999000 7750600 0 6 5 11 1190 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polyadenylation specificity factor subunit 1 CPSF1 sp|Q10570|CPSF1_HUMAN Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CPSF1 PE=1 SV=2 1 6 6 6 1 5 2 1 5 2 1 5 2 5.1 5.1 5.1 160.88 1443 1443 1.42 7 5 0 62.764 By matching By MS/MS By MS/MS 0.8 4 2.4 45049000 1245200 30714000 13090000 0 14285000 0 0 6 2 8 1194 4395;6562;10588;12587;14780;15732 True;True;True;True;True;True 4583;6842;11155;13245;15516;16489 18097;18098;27999;45788;54707;64895;64896;64897;64898;68773;68774;68775 14972;23758;38094;45715;54709;54710;54711;57968 14972;23758;38094;45715;54710;57968 Q10713 Q10713 2 2 2 Mitochondrial-processing peptidase subunit alpha PMPCA sp|Q10713|MPPA_HUMAN Mitochondrial-processing peptidase subunit alpha OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PMPCA PE=1 SV=2 1 2 2 2 1 0 2 1 0 2 1 0 2 4.8 4.8 4.8 58.252 525 525 3.8 1 4 0 16.682 By matching By MS/MS 1.5 0 4.8 9070900 743710 0 8327200 0 0 1362200 0 0 3 3 1195 4659;9394 True;True 4858;9769 19718;19719;19720;39858;39859 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9438;22335;26728;32289 Q12904 Q12904 2 2 2 Aminoacyl tRNA synthase complex-interacting multifunctional protein 1;Endothelial monocyte-activating polypeptide 2 AIMP1 sp|Q12904|AIMP1_HUMAN Aminoacyl tRNA synthase complex-interacting multifunctional protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AIMP1 PE=1 SV=2 1 2 2 2 0 2 2 0 2 2 0 2 2 6.4 6.4 6.4 34.352 312 312 5.8 1 4 0 12.951 By matching By MS/MS 0 6.4 6.4 19643000 0 8531800 11111000 0 2416400 2075200 0 0 2 2 1209 612;4170 True;True 635;4344 2539;2540;17126;17127;17128 2078;14157 2078;14157 Q12905 Q12905 15 15 15 Interleukin enhancer-binding factor 2 ILF2 sp|Q12905|ILF2_HUMAN Interleukin enhancer-binding factor 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ILF2 PE=1 SV=2 1 15 15 15 4 14 12 4 14 12 4 14 12 37.4 37.4 37.4 43.062 390 390 5.25 3 2 7 16 45 24 22 2 1 0 189.74 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 14.4 31.8 37.2 4193900000 82421000 1931000000 2180500000 96117000 572990000 252760000 6 57 54 117 1210 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Q13185 8 8 7 Chromobox protein homolog 3 CBX3 sp|Q13185|CBX3_HUMAN Chromobox protein homolog 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CBX3 PE=1 SV=4 1 8 8 7 2 6 8 2 6 8 1 5 7 42.1 42.1 33.3 20.811 183 183 7.22 1 1 1 5 33 8 9 1 0 80.319 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 15.3 35 42.1 2753300000 30599000 229570000 2493100000 58311000 60215000 405360000 3 13 31 47 1228 2168;6016;7286;9192;12258;14166;15285;15426 True;True;True;True;True;True;True;True 2264;6265;6266;6267;7586;9566;12898;14878;16032;16176 9246;9247;9248;25417;25418;25419;25420;25421;25422;25423;25424;25425;25426;25427;25428;25429;25430;25431;25432;25433;25434;25435;25436;25437;25438;25439;25440;25441;25442;25443;25444;25445;25446;30960;30961;30962;30963;30964;30965;30966;30967;30968;30969;39086;39087;39088;39089;39090;53308;62263;62264;62265;66934;66935;66936;67516;67517;67518;67519 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3B subunit 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SF3B2 PE=1 SV=2 1 20 20 20 2 17 16 2 17 16 2 17 16 32.4 32.4 32.4 100.23 895 895 2.25 12 37 13 6 1 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 2.5 28.9 28 587300000 3333300 189970000 394000000 10354000 126510000 38521000 1 26 24 51 1248 177;1281;3215;4550;4551;4873;6524;6930;7140;7393;7489;11117;11188;11360;12935;13956;14335;14336;14937;15656 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 180;1341;3346;4745;4746;5077;6803;7221;7435;7693;7796;11701;11772;11949;13600;14664;15053;15054;15678;16409 655;656;657;5621;5622;5623;13151;13152;13153;13154;19245;19246;19247;19248;19249;20486;20487;27816;27817;27818;27819;27820;27821;27822;29584;29585;29586;30364;30365;30366;31458;31459;31460;31461;31829;31830;31831;31832;31833;48068;48069;48444;49046;56357;56358;56359;61406;63058;63059;63060;63061;63062;63063;65503;65504;65505;65506;65507;65508;65509;65510;65511;65512;65513;65514;65515;68421;68422;68423 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118 118 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 SPTAN1 sp|Q13813|SPTN1_HUMAN Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SPTAN1 PE=1 SV=3 1 118 118 118 9 87 110 9 87 110 9 87 110 57.8 57.8 57.8 284.54 2472 2472 1.4 260 103 12 2 2 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 3.7 42.8 55.1 5558500000 36116000 1838700000 3683700000 33099000 851980000 820330000 1 128 173 302 1268 108;109;274;275;518;779;882;883;1101;1166;1560;1881;1882;1896;1897;1938;1978;1982;2011;2017;2021;2025;2041;2226;2274;2275;2282;2334;2403;2424;2457;2482;2623;2863;2864;3012;3056;3120;4260;4307;4615;4768;4798;5123;5249;5250;5526;5527;5528;5531;5535;5545;5546;5665;5757;5804;6580;6877;6902;6946;6948;6949;6951;6962;6963;6968;7058;7065;7285;7360;7481;7574;7575;7584;7640;7874;8033;8085;8088;8089;8090;8132;8228;8230;8485;8545;8786;8849;8862;8932;9184;9750;9791;9860;10438;10557;10875;10977;11257;11311;11414;11415;11560;11661;12199;12253;12518;12580;12618;12930;13290;13969;14039;14615;14848;15478;15556;15965 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sapiens OX=9606 GN=KARS1 PE=1 SV=3 1 5 5 5 0 2 3 0 2 3 0 2 3 9.2 9.2 9.2 68.047 597 597 3 5 0 31.317 By MS/MS By MS/MS 0 4.7 4.5 22868000 0 8191400 14676000 0 0 2846500 0 2 3 5 1336 8044;9731;14002;15754;15931 True;True;True;True;True 8377;10199;14710;16511;16695 34351;41463;61537;68884;69639 28870;34486;51818;58047;58682 28870;34486;51818;58047;58682 Q15050 Q15050 8 8 8 Ribosome biogenesis regulatory protein homolog RRS1 sp|Q15050|RRS1_HUMAN Ribosome biogenesis regulatory protein homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RRS1 PE=1 SV=2 1 8 8 8 2 5 6 2 5 6 2 5 6 30.1 30.1 30.1 41.193 365 365 4.84 1 3 13 2 0 100.66 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 7.9 18.1 19.5 100480000 3141500 24899000 72436000 0 10500000 6552100 2 4 8 14 1337 351;2083;3422;6886;7120;9540;9794;14167 True;True;True;True;True;True;True;True 366;2176;3561;7177;7415;9943;10275;14879 1447;1448;8956;8957;8958;13986;13987;29439;29440;29441;29442;30311;30312;40395;40396;40397;41726;62266;62267 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[Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PDK3 PE=1 SV=1 1 2 2 2 0 2 1 0 2 1 0 2 1 7.6 7.6 7.6 46.938 406 406 5 3 0 13.897 By MS/MS By MS/MS 0 7.6 2.7 14905000 0 11202000 3703600 0 2887500 0 0 2 1 3 1346 6488;9700 True;True 6764;10162 27604;27605;41376 23336;23337;34423 23336;34423 Q15125 Q15125 1 1 1 3-beta-hydroxysteroid-Delta(8),Delta(7)-isomerase EBP sp|Q15125|EBP_HUMAN 3-beta-hydroxysteroid-Delta(8),Delta(7)-isomerase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EBP PE=1 SV=3 1 1 1 1 0 1 0 0 1 0 0 1 0 7 7 7 26.352 230 230 7 1 0.005893 6.3954 By MS/MS 0 7 0 3288800 0 3288800 0 0 1888400 0 0 1 0 1 1347 13747 True 14448 60115 50326 50326 Q15149 Q15149 148 148 140 Plectin PLEC sp|Q15149|PLEC_HUMAN Plectin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PLEC PE=1 SV=3 1 148 148 140 19 134 89 19 134 89 17 126 82 35.5 35.5 33.3 531.78 4684 4684 1.32 255 52 14 3 2 1 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 4.6 32.5 23.5 3812200000 36299000 2189800000 1586100000 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Microtubule-associated protein RP/EB family member 1 MAPRE1 sp|Q15691|MARE1_HUMAN Microtubule-associated protein RP/EB family member 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MAPRE1 PE=1 SV=3 1 4 4 4 0 3 4 0 3 4 0 3 4 26.5 26.5 26.5 29.999 268 268 6.38 10 6 0 65.81 By MS/MS By MS/MS 0 20.1 26.5 134180000 0 34362000 99823000 0 13508000 14760000 0 7 7 14 1379 1431;3602;7157;10915 True;True;True;True 1500;3752;7452;11495 6388;6389;6390;6391;14745;30419;30420;30421;30422;30423;30424;30425;30426;47234;47235;47236 5309;5310;5311;5312;12087;25670;25671;25672;25673;25674;25675;39369;39370;39371 5309;12087;25674;39370 Q15717;Q12926;P26378 Q15717 16;1;1 16;1;1 16;1;1 ELAV-like protein 1 ELAVL1 sp|Q15717|ELAV1_HUMAN ELAV-like protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ELAVL1 PE=1 SV=2 3 16 16 16 5 16 11 5 16 11 5 16 11 52.5 52.5 52.5 36.091 326 326;359;385 5.68 2 4 7 14 42 10 4 1 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 18.4 52.5 43.6 2760500000 40099000 1459600000 1260800000 96689000 476940000 172500000 1 42 24 67 1380 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1584;6124;6806;8689;11499;11512 6719;24797;24798;27829;35727;35728;47241;47315 5598;20919;23582;29965;39377;39452 5598;20919;23582;29965;39377;39452 Q2TAY7 Q2TAY7 13 13 13 WD40 repeat-containing protein SMU1;WD40 repeat-containing protein SMU1, N-terminally processed SMU1 sp|Q2TAY7|SMU1_HUMAN WD40 repeat-containing protein SMU1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SMU1 PE=1 SV=2 1 13 13 13 1 9 13 1 9 13 1 9 13 34.7 34.7 34.7 57.543 513 513 3.9 4 3 7 24 9 1 3 0 226.98 By matching By MS/MS By MS/MS 1.9 24.2 34.7 522660000 381000 249590000 272690000 0 89243000 34703000 0 17 17 34 1407 87;176;2206;2225;2285;2301;8076;8509;12023;12192;12387;15471;15712 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 89;179;2303;2323;2387;2403;8410;8853;8854;12651;12829;13039;16221;16469 291;292;293;294;295;296;297;654;9351;9352;9453;9454;9455;9456;9738;9777;9778;34476;34477;34478;36416;36417;36418;36419;36420;36421;36422;36423;36424;36425;36426;36427;52013;52014;52975;52976;52977;53868;53869;53870;67631;67632;67633;68668;68669;68670;68671;68672;68673;68674;68675 244;245;246;247;537;7675;7676;7755;7756;7966;7997;7998;28953;28954;28955;30554;30555;30556;30557;30558;30559;43329;44249;44250;45022;45023;45024;57023;57024;57880;57881;57882;57883;57884;57885;57886 244;537;7676;7756;7966;7997;28953;30558;43329;44249;45022;57024;57882 628 162 Q2TB18 Q2TB18 1 1 1 Protein asteroid homolog 1 ASTE1 sp|Q2TB18|ASTE1_HUMAN Protein asteroid homolog 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ASTE1 PE=1 SV=1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 2.1 2.1 2.1 77.092 679 679 4 1 1 1 0.0050343 6.4703 By MS/MS By matching 0 2.1 2.1 4063000 0 2327700 1735400 0 895220 0 0 1 0 1 1408 4931 True 5137 20694;20695;20696 17369 17369 Q32P28 Q32P28 2 2 2 Prolyl 3-hydroxylase 1 LEPRE1 sp|Q32P28|P3H1_HUMAN Prolyl 3-hydroxylase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=P3H1 PE=1 SV=2 1 2 2 2 0 2 1 0 2 1 0 2 1 3 3 3 83.393 736 736 2.33 2 1 0 15.415 By MS/MS By MS/MS 0 3 1.4 6343600 0 1877800 4465800 0 845590 0 0 2 1 3 1409 2005;12485 True;True 2090;13138 8510;8511;54187 6999;7000;45284 7000;45284 Q3B726 Q3B726 1 1 1 DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43 TWISTNB sp|Q3B726|RPA43_HUMAN DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TWISTNB PE=1 SV=1 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 4.7 4.7 4.7 37.432 338 338 5 1 0.0063063 6.3496 By MS/MS 0 0 4.7 7246700 0 0 7246700 0 0 1010800 0 0 1 1 1410 15920 True 16684 69612 58660 58660 Q3KQU3 Q3KQU3 4 4 4 MAP7 domain-containing protein 1 MAP7D1 sp|Q3KQU3|MA7D1_HUMAN MAP7 domain-containing protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MAP7D1 PE=1 SV=1 1 4 4 4 0 4 1 0 4 1 0 4 1 5 5 5 92.819 841 841 2 1 5 1 0 27.37 By MS/MS By MS/MS 0 5 1.3 9456800 0 5536400 3920400 0 2465000 0 0 4 2 6 1411 8542;10675;13538;13539 True;True;True;True 8892;11245;14228;14229 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assembly integral membrane protein VMA21 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=VMA21 PE=1 SV=1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 11.9 11.9 11.9 11.354 101 101 10 2 0.001006 7.6317 By MS/MS By MS/MS 0 11.9 11.9 5257500 0 3640800 1616800 0 0 3536000 0 1 0 1 1414 112 True 114 404;405 330;331 330 Q3ZCM7 Q3ZCM7 10 1 1 Tubulin beta-8 chain TUBB8 sp|Q3ZCM7|TBB8_HUMAN Tubulin beta-8 chain OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TUBB8 PE=1 SV=2 1 10 1 1 5 9 10 0 0 1 0 0 1 20.9 3.8 3.8 49.775 444 444 5 1 1 -2 By matching By matching By MS/MS 13.1 17.1 20.9 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 + 1415 1425;3894;3895;6460;7012;7529;7979;9820;10347;12938 False;False;False;False;False;False;False;True;False;False 1492;1493;4055;4056;6735;7303;7304;7838;7839;8309;8310;10312;10895;13603 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Q6IAN0 1 1 1 Dehydrogenase/reductase SDR family member 7B DHRS7B sp|Q6IAN0|DRS7B_HUMAN Dehydrogenase/reductase SDR family member 7B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DHRS7B PE=1 SV=2 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 4.6 4.6 4.6 35.119 325 325 6 2 0.0009985 7.5286 By MS/MS By MS/MS 0 4.6 4.6 9189500 0 983110 8206400 0 0 1227800 0 1 1 2 1476 12478 True 13131 54168;54169 45271;45272 45272 Q6IBS0 Q6IBS0 2 1 1 Twinfilin-2 TWF2 sp|Q6IBS0|TWF2_HUMAN Twinfilin-2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TWF2 PE=1 SV=2 1 2 1 1 0 2 1 0 1 0 0 1 0 6.9 4.9 4.9 39.548 349 349 6 1 0.0091783 6.1316 By MS/MS By matching 0 6.9 2 3593200 0 3593200 0 0 1243800 0 0 1 0 1 1477 5553;15675 True;False 5783;16429 23340;68500;68501;68502;68503 19714;57756;57757 19714;57757 Q6IPU0 Q6IPU0 3 3 3 Centromere protein P CENPP sp|Q6IPU0|CENPP_HUMAN Centromere protein P OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CENPP PE=1 SV=1 1 3 3 3 0 0 3 0 0 3 0 0 3 9.7 9.7 9.7 33.165 288 288 6 3 0 45.438 By MS/MS 0 0 9.7 15656000 0 0 15656000 0 0 2342300 0 0 3 3 1478 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SV=2;sp|Q9H6T0|ESRP2_HUMAN Epithelial splicing regulatory protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ESRP2 PE=1 SV=1 2 1 1 1 0 1 0 0 1 0 0 1 0 1.8 1.8 1.8 75.585 681 681;727 3 1 0.0010183 7.9106 By MS/MS 0 1.8 0 1975500 0 1975500 0 0 842160 0 0 1 0 1 1482 12657 True 13315 55035 45984 45984 Q6NZI2 Q6NZI2 5 5 5 Polymerase I and transcript release factor PTRF sp|Q6NZI2|CAVN1_HUMAN Caveolae-associated protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CAVIN1 PE=1 SV=1 1 5 5 5 1 2 5 1 2 5 1 2 5 14.1 14.1 14.1 43.476 390 390 4.43 1 7 5 1 0 80.655 By matching By MS/MS By MS/MS 2.8 7.4 14.1 96437000 1971000 17190000 77276000 0 7655400 9629300 0 3 6 9 1483 6017;7041;7744;11761;11891 True;True;True;True;True 6268;7333;8062;12376;12511 25447;25448;25449;25450;29981;29982;29983;29984;29985;32993;50800;51418;51419;51420 21484;21485;25348;25349;25350;27746;42226;42748;42749 21485;25348;27746;42226;42748 Q6P087 Q6P087 2 2 2 RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 3 RPUSD3 sp|Q6P087|RUSD3_HUMAN 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protein MPRIP sp|Q6WCQ1|MPRIP_HUMAN Myosin phosphatase Rho-interacting protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MPRIP PE=1 SV=3 1 19 19 19 1 8 16 1 8 16 1 8 16 27.2 27.2 27.2 116.53 1025 1025 1.74 13 23 1 1 0 204.52 By matching By MS/MS By MS/MS 1.2 12 23.1 208670000 6644000 36252000 165780000 0 24121000 29556000 0 8 18 26 1507 1633;2697;3129;3267;3653;4332;5624;8181;9049;10854;11234;11263;12404;12427;12512;13184;13378;14350;15420 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1705;2812;3257;3400;3806;4515;5859;8519;9417;11432;11820;11849;13056;13079;13165;13859;14058;15069;16170 7211;11223;11224;12879;12880;12881;13365;14971;14972;17757;17758;23758;23759;23760;35011;38571;38572;46987;46988;48634;48721;53935;53936;53937;53993;53994;54280;54281;57261;57262;57263;57264;58358;58359;58360;63141;63142;67504 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protein 6 PHF6 sp|Q8IWS0|PHF6_HUMAN PHD finger protein 6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PHF6 PE=1 SV=1 1 5 5 5 0 2 4 0 2 4 0 2 4 13.4 13.4 13.4 41.29 365 365 5.09 1 1 6 2 1 0 64.18 By MS/MS By MS/MS 0 6.8 11.5 83229000 0 3399700 79829000 0 0 11330000 0 2 4 6 1576 4633;7987;12724;13843;13844 True;True;True;True;True 4832;8318;13383;14544;14545 19635;19636;34112;55406;55407;55408;55409;55410;60694;60695;60696 16541;16542;28685;46334;46335;51023;51024 16541;28685;46334;51023;51024 Q8IWX8 Q8IWX8 7 7 7 Calcium homeostasis endoplasmic reticulum protein CHERP sp|Q8IWX8|CHERP_HUMAN Calcium homeostasis endoplasmic reticulum protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CHERP PE=1 SV=3 1 7 7 7 0 4 6 0 4 6 0 4 6 11.9 11.9 11.9 103.7 916 916 2.17 10 2 0 69.12 By MS/MS By MS/MS 0 7.1 11 78339000 0 20723000 57616000 0 13008000 9166800 0 4 6 10 1577 2970;6576;8179;8420;10485;10872;10914 True;True;True;True;True;True;True 3093;6856;8517;8763;11044;11452;11494 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Q8IXH7 1 1 1 Negative elongation factor C/D NELFCD sp|Q8IXH7|NELFD_HUMAN Negative elongation factor C/D OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NELFCD PE=1 SV=2 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 3.1 3.1 3.1 66.246 590 590 3.5 1 1 0.0066138 6.2034 By MS/MS 0 0 3.1 1829600 0 0 1829600 0 0 326130 0 0 1 1 1581 14892 True 15633 65326;65327 55064 55064 Q8IXK0 Q8IXK0 2 2 2 Polyhomeotic-like protein 2 PHC2 sp|Q8IXK0|PHC2_HUMAN Polyhomeotic-like protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PHC2 PE=1 SV=1 1 2 2 2 0 1 2 0 1 2 0 1 2 3 3 3 90.712 858 858 5 1 2 1 0 12.842 By matching By MS/MS 0 1.9 3 18996000 0 2032900 16963000 0 0 2399500 0 0 2 2 1582 1919;2029 True;True 2001;2116 8257;8621;8622;8623 6824;7068 6824;7068 Q8IXM2 Q8IXM2 2 2 2 Chromatin complexes subunit BAP18 BAP18 sp|Q8IXM2|BAP18_HUMAN Chromatin complexes subunit BAP18 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=BAP18 PE=1 SV=1 1 2 2 2 1 2 2 1 2 2 1 2 2 19.8 19.8 19.8 17.9 172 172 7.11 1 5 3 0 45.676 By matching By MS/MS By MS/MS 11.6 19.8 19.8 93974000 3068900 20469000 70437000 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356;1038;2201;3936;4922;5245;5740;6562;8638;10861;12116;12122;12624;14548 1416;1417;1418;4265;4266;4267;9019;9020;15635;19936;19937;19938;21257;21258;23126;26810;26811;35552;35553;35554;35555;35556;35557;44469;49734;49735;49756;51931;51932;51933;60704;60705 1132;1133;1134;3543;3544;3545;7436;7437;12851;16733;17905;19470;22640;22641;29835;29836;29837;37024;41387;41404;43254;43255;43256;51029;51030 1134;3545;7437;12851;16733;17905;19470;22640;29837;37024;41387;41404;43254;51030 Q8IY18 Q8IY18 3 3 3 Structural maintenance of chromosomes protein 5 SMC5 sp|Q8IY18|SMC5_HUMAN Structural maintenance of chromosomes protein 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SMC5 PE=1 SV=2 1 3 3 3 0 0 3 0 0 3 0 0 3 4.5 4.5 4.5 128.81 1101 1101 1.75 1 3 0 19.311 By MS/MS 0 0 4.5 10815000 0 0 10815000 0 0 2433300 0 0 4 4 1588 12650;12800;15237 True;True;True 13308;13461;15984 55016;55017;55694;66754 45968;45969;46560;56314 45968;46560;56314 Q8IY63;Q4VCS5 Q8IY63;Q4VCS5 2;1 2;1 2;1 Angiomotin-like protein 1;Angiomotin AMOTL1;AMOT sp|Q8IY63|AMOL1_HUMAN Angiomotin-like protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AMOTL1 PE=1 SV=1;sp|Q4VCS5|AMOT_HUMAN Angiomotin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AMOT PE=1 SV=1 2 2 2 2 0 0 2 0 0 2 0 0 2 2.6 2.6 2.6 106.57 956 956;1084 1.67 1 2 0 12.195 By MS/MS 0 0 2.6 13852000 0 0 13852000 0 0 3088600 0 0 1 1 1589 5369;6112 True;True 5589;6370 22518;26064;26065 18937;22039 18937;22039 Q8IY81 Q8IY81 12 12 12 pre-rRNA processing protein FTSJ3 FTSJ3 sp|Q8IY81|SPB1_HUMAN pre-rRNA 2-O-ribose RNA methyltransferase FTSJ3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FTSJ3 PE=1 SV=2 1 12 12 12 0 9 10 0 9 10 0 9 10 22.3 22.3 22.3 96.557 847 847 2.72 4 16 7 11 1 0 232.89 By MS/MS By MS/MS 0 14.9 20.4 270870000 0 100430000 170440000 0 43915000 33575000 0 11 14 25 1590 318;1173;1936;4526;5041;6130;6768;9102;11337;11732;13021;13710 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 330;1230;2018;4721;5249;6388;7055;9473;11926;12343;13689;14406 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25637;36689;36690;58953 25637;36690;58953 Q92841 Q92841 28 20 20 Probable ATP-dependent RNA helicase DDX17 DDX17 sp|Q92841|DDX17_HUMAN Probable ATP-dependent RNA helicase DDX17 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DDX17 PE=1 SV=2 1 28 20 20 13 26 27 9 18 20 9 18 20 42.2 31.8 31.8 80.272 729 729 3.36 22 32 59 36 12 10 3 2 5 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 19.6 42.2 42.2 4399200000 104980000 1339800000 2954500000 260990000 444040000 535900000 7 73 73 153 1725 1014;1023;2058;2349;2903;3253;4076;4257;4661;5032;5110;6651;6990;8027;8086;8087;8539;9154;9155;9691;10070;10984;11194;12533;12633;13219;13312;14595 False;True;True;True;True;True;True;False;False;True;False;False;False;True;True;True;True;True;True;False;True;True;False;True;True;True;True;True 1067;1077;1078;2149;2150;2452;3025;3386;4247;4436;4860;5240;5321;6934;7281;8360;8420;8421;8889;9527;9528;10149;10150;10151;10599;11566;11778;11779;13187;13291;13895;13990;15327 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subunit methyltransferase NEP1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EMG1 PE=1 SV=4 1 10 10 10 0 5 10 0 5 10 0 5 10 50.8 50.8 50.8 26.72 244 244 7.08 4 17 1 1 1 0 89.517 By MS/MS By MS/MS 0 24.6 50.8 403260000 0 106010000 297250000 0 70615000 44306000 0 3 16 19 1736 137;485;2100;9904;10431;10591;10684;11925;14389;15125 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 140;504;2194;10427;10987;11158;11254;12548;15108;15867 487;488;489;490;2054;2055;2056;8998;8999;42417;42418;45114;45791;45792;45793;46320;51573;63332;63333;63334;63335;63336;66236;66237 401;402;403;1648;1649;7423;7424;35282;37538;38097;38098;38571;42867;53504;53505;53506;53507;53508;55802 401;1648;7423;35282;37538;38098;38571;42867;53504;55802 Q93008;O00507 Q93008 5;1 5;1 5;1 Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X USP9X sp|Q93008|USP9X_HUMAN Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X OS=Homo sapiens OX=9606 GN=USP9X PE=1 SV=3 2 5 5 5 2 2 5 2 2 5 2 2 5 2.8 2.8 2.8 292.28 2570 2570;2555 2.08 5 2 4 1 0 46.168 By 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H2A type 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=H2AW PE=1 SV=3;sp|P04908|H2A1B_HUMAN Histone H2A type 1-B/E OS=Homo sapiens OX=9606 GN=H2AC4 PE=1 SV=2 3 14 3 3 4 14 13 0 3 3 0 3 3 76.2 28.5 28.5 14.105 130 130;130;130 7.73 3 8 0 25.041 By matching By MS/MS By MS/MS 27.7 76.2 76.2 171250000 0 76137000 95109000 0 35183000 16694000 0 5 4 9 1740 489;490;5448;5450;5452;6052;8304;8438;9979;9982;14319;15172;15173;15174 False;False;False;False;True;False;True;False;False;True;False;False;False;False 508;509;5672;5674;5676;6307;8645;8782;10505;10508;15036;15914;15915;15916 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ligase UHRF2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UHRF2 PE=1 SV=1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 1.9 1.9 1.9 89.984 802 802 2.5 1 1 0.0024272 7.2052 By MS/MS By MS/MS 0 1.9 1.9 7024900 0 1661600 5363400 0 0 1040200 0 1 1 2 1819 5908 True 6154 24920;24921 21008;21009 21009 Q96PU8 Q96PU8 1 1 1 Protein quaking QKI sp|Q96PU8|QKI_HUMAN Protein quaking OS=Homo sapiens OX=9606 GN=QKI PE=1 SV=1 1 1 1 1 0 1 0 0 1 0 0 1 0 4.7 4.7 4.7 37.67 341 341 6 1 0.0036917 6.5368 By MS/MS 0 4.7 0 4389400 0 4389400 0 0 1519500 0 0 1 0 1 1820 9427 True 9802 39951 33291 33291 Q96PV6 Q96PV6 1 1 1 Leukocyte receptor cluster member 8 LENG8 sp|Q96PV6|LENG8_HUMAN Leukocyte receptor cluster member 8 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=LENG8 PE=1 SV=3 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 3.6 3.6 3.6 88.156 800 800 2.5 1 1 0 11.974 By MS/MS By matching 0 3.6 3.6 10819000 0 4853500 5965600 0 0 1157000 0 1 0 1 1821 11503 True 12097 49641;49642 41312 41312 Q96QA5 Q96QA5 3 3 3 Gasdermin-A GSDMA sp|Q96QA5|GSDMA_HUMAN Gasdermin-A OS=Homo sapiens OX=9606 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16331;17200;21675;31155;38774;50348;58346 Q96QD9 Q96QD9 2 2 2 UAP56-interacting factor FYTTD1 sp|Q96QD9|UIF_HUMAN UAP56-interacting factor OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FYTTD1 PE=1 SV=3 1 2 2 2 0 2 2 0 2 2 0 2 2 7.2 7.2 7.2 35.818 318 318 6 4 0 11.489 By MS/MS By MS/MS 0 7.2 7.2 22247000 0 8262600 13985000 0 2445100 2507400 0 2 1 3 1824 5145;10125 True;True 5358;10662 21585;21586;43459;43460 18163;36165;36166 18163;36165 Q96QE3 Q96QE3 1 1 1 ATPase family AAA domain-containing protein 5 ATAD5 sp|Q96QE3|ATAD5_HUMAN ATPase family AAA domain-containing protein 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ATAD5 PE=1 SV=4 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0.4 0.4 0.4 207.57 1844 1844 1 1 0.0023641 6.8856 By MS/MS 0 0 0.4 2464100 0 0 2464100 0 0 530930 0 0 1 1 1825 14020 True 14729 61639 51929 51929 Q96QE5 Q96QE5 1 1 1 Transcription elongation factor, mitochondrial TEFM sp|Q96QE5|TEFM_HUMAN Transcription elongation factor, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TEFM PE=1 SV=1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 4.2 4.2 4.2 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Neurabin-2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PPP1R9B PE=1 SV=3 1 3 3 3 0 2 1 0 2 1 0 2 1 5.5 5.5 5.5 89.333 817 817 2 3 0 27.264 By MS/MS By MS/MS 0 4 1.5 14700000 0 8097800 6601700 0 0 1491900 0 2 1 3 1831 1103;3557;6496 True;True;True 1160;3704;6772 4782;14545;27623 3962;11939;23347 3962;11939;23347 Q96SB4;Q9UPE1;P78362 Q96SB4 3;1;1 3;1;1 3;1;1 SRSF protein kinase 1 SRPK1 sp|Q96SB4|SRPK1_HUMAN SRSF protein kinase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SRPK1 PE=1 SV=2 3 3 3 3 0 3 2 0 3 2 0 3 2 5.2 5.2 5.2 74.324 655 655;567;688 2.56 2 2 3 2 0 20.12 By MS/MS By MS/MS 0 5.2 3.1 32945000 0 16523000 16422000 0 4552100 5731400 0 2 2 4 1832 3098;5314;12659 True;True;True 3225;5534;13317 12784;12785;12786;12787;22213;22214;22215;55063;55064 10454;18663;18664;46004 10454;18664;46004 Q96SB8 Q96SB8 8 8 8 Structural maintenance of chromosomes protein 6 SMC6 sp|Q96SB8|SMC6_HUMAN Structural maintenance of chromosomes protein 6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SMC6 PE=1 SV=2 1 8 8 8 0 2 7 0 2 7 0 2 7 11.5 11.5 11.5 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protein Sin3a SIN3A sp|Q96ST3|SIN3A_HUMAN Paired amphipathic helix protein Sin3a OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SIN3A PE=1 SV=2 1 5 5 5 0 1 4 0 1 4 0 1 4 4.5 4.5 4.5 145.17 1273 1273 1.62 3 5 0 30.204 By MS/MS By MS/MS 0 1 3.5 46060000 0 2270800 43789000 0 0 9681500 0 1 5 6 1836 336;415;2760;5332;12215 True;True;True;True;True 350;430;2877;5552;12853 1399;1694;1695;11530;11531;22298;22299;53118 1117;1362;9423;9424;18743;44376 1117;1362;9423;18743;44376 Q96T23 Q96T23 22 22 22 Remodeling and spacing factor 1 RSF1 sp|Q96T23|RSF1_HUMAN Remodeling and spacing factor 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RSF1 PE=1 SV=2 1 22 22 22 3 11 20 3 11 20 3 11 20 18.7 18.7 18.7 163.82 1441 1441 1.63 40 18 6 3 1 0 323.31 By matching By MS/MS By MS/MS 2.4 9.8 17.4 512180000 17880000 54205000 440090000 23588000 37740000 73764000 0 11 36 47 1837 1564;3538;3539;4301;6558;7280;7672;7691;8931;9292;9678;9921;10015;10135;10137;10475;11347;12620;12661;12662;14724;15654 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3004;16716;16785;31230 Q99873 Q99873 1 1 1 Protein arginine N-methyltransferase 1 PRMT1 sp|Q99873|ANM1_HUMAN Protein arginine N-methyltransferase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PRMT1 PE=1 SV=3 1 1 1 1 0 1 0 0 1 0 0 1 0 4.3 4.3 4.3 42.461 371 371 6 1 0.0014648 7.3214 By MS/MS 0 4.3 0 3941600 0 3941600 0 0 1364500 0 0 1 0 1 1868 13117 True 13789 56949 47560 47560 Q99935 Q99935 6 6 6 Proline-rich protein 1;Opiorphin PROL1 sp|Q99935|PROL1_HUMAN Opiorphin prepropeptide OS=Homo sapiens OX=9606 GN=OPRPN PE=1 SV=2 1 6 6 6 6 0 0 6 0 0 6 0 0 30.6 30.6 30.6 27.216 248 248 6.48 2 2 2 3 3 2 2 4 6 5 0 44.189 By MS/MS 30.6 0 0 105600000 105600000 0 0 117060000 0 0 18 0 0 18 1869 3999;7808;8598;11553;11554;14938 True;True;True;True;True;True 4166;8129;8952;12155;12156;15679 16426;16427;16428;16429;16430;16431;16432;33285;36858;36859;36860;36861;36862;36863;36864;36865;36866;49882;49883;49884;49885;49886;49887;49888;49889;49890;49891;49892;49893;65516;65517 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Translational activator of cytochrome c oxidase 1 TACO1 sp|Q9BSH4|TACO1_HUMAN Translational activator of cytochrome c oxidase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TACO1 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 6.1 6.1 6.1 32.477 297 297 6.33 2 1 0.00098039 7.3484 By matching By MS/MS 6.1 0 6.1 10306000 1825800 0 8479900 0 0 1432500 0 0 1 1 1897 4846 True 5050 20413;20414;20415 17127 17127 Q9BSJ8 Q9BSJ8 1 1 1 Extended synaptotagmin-1 ESYT1 sp|Q9BSJ8|ESYT1_HUMAN Extended synaptotagmin-1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ESYT1 PE=1 SV=1 1 1 1 1 0 1 0 0 1 0 0 1 0 1.4 1.4 1.4 122.85 1104 1104 2 2 0.0062361 6.2679 By MS/MS 0 1.4 0 1757900 0 1757900 0 0 791600 0 0 2 0 2 1898 8488 True 8832 36278;36279 30432;30433 30432 Q9BT23 Q9BT23 1 1 1 LIM domain-containing protein 2 LIMD2 sp|Q9BT23|LIMD2_HUMAN LIM domain-containing protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=LIMD2 PE=1 SV=1 1 1 1 1 0 1 0 0 1 0 0 1 0 13.4 13.4 13.4 14.07 127 127 8 1 0 17.3 By MS/MS 0 13.4 0 4021700 0 4021700 0 0 1829700 0 0 1 0 1 1899 9584 True 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1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=REPIN1 PE=1 SV=1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 2.6 2.6 2.6 63.574 567 567 3.33 2 1 0.001001 7.548 By MS/MS By MS/MS 0 2.6 2.6 12628000 0 6888100 5740100 0 2521700 0 0 1 1 2 1923 8446 True 8790 36170;36171;36172 30355;30356 30356 Q9BWF3;Q9BQ04 Q9BWF3;Q9BQ04 10;8 10;8 10;8 RNA-binding protein 4;RNA-binding protein 4B RBM4;RBM4B sp|Q9BWF3|RBM4_HUMAN RNA-binding protein 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RBM4 PE=1 SV=1;sp|Q9BQ04|RBM4B_HUMAN RNA-binding protein 4B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RBM4B PE=1 SV=1 2 10 10 10 1 7 10 1 7 10 1 7 10 32.4 32.4 32.4 40.313 364 364;359 5.85 2 19 13 10 1 1 0 192.91 By matching By MS/MS By MS/MS 4.4 25 32.4 374550000 6662400 86581000 281310000 0 29767000 42015000 0 12 17 29 1924 1268;2352;2503;4657;7792;7985;9631;10645;12180;13963 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1328;2455;2613;4856;8112;8316;10071;11215;12817;14671 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34457;47203;56891;58768 Q9BWS9 Q9BWS9 4 4 4 Chitinase domain-containing protein 1 CHID1 sp|Q9BWS9|CHID1_HUMAN Chitinase domain-containing protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CHID1 PE=1 SV=1 1 4 4 4 0 1 3 0 1 3 0 1 3 13.5 13.5 13.5 44.94 393 393 5 1 5 1 0 29.412 By MS/MS By MS/MS 0 3.1 10.4 78248000 0 13541000 64706000 0 0 9032800 0 2 4 6 1926 4046;5641;10589;14361 True;True;True;True 4215;5876;11156;15080 16674;16675;23819;45789;63205;63206;63207 13820;13821;20124;38095;53406;53407;53408 13820;20124;38095;53406 Q9BWT6 Q9BWT6 1 1 1 Meiotic nuclear division protein 1 homolog MND1 sp|Q9BWT6|MND1_HUMAN Meiotic nuclear division protein 1 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MND1 PE=1 SV=1 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 4.9 4.9 4.9 23.753 205 205 8.5 1 1 0.0062167 6.2431 By MS/MS 0 0 4.9 17514000 0 0 17514000 0 0 4359800 0 0 2 2 1927 2291 True 2393 9750;9751 7976;7977 7976 Q9BXJ9;Q6N069 Q9BXJ9;Q6N069 2;1 2;1 2;1 N-alpha-acetyltransferase 15, NatA auxiliary subunit;N-alpha-acetyltransferase 16, NatA auxiliary subunit NAA15;NAA16 sp|Q9BXJ9|NAA15_HUMAN N-alpha-acetyltransferase 15, NatA auxiliary subunit OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NAA15 PE=1 SV=1;sp|Q6N069|NAA16_HUMAN N-alpha-acetyltransferase 16, NatA auxiliary subunit OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NAA16 PE=1 SV=2 2 2 2 2 0 1 1 0 1 1 0 1 1 4.5 4.5 4.5 101.27 866 866;864 2 2 0 28.71 By MS/MS By MS/MS 0 1.2 3.3 1300600 0 0 1300600 0 0 293920 0 1 1 2 1928 2009;7805 True;True 2095;8126 8523;33263 7010;27971 7010;27971 Q9BXP5 Q9BXP5 13 13 13 Serrate RNA effector molecule homolog SRRT sp|Q9BXP5|SRRT_HUMAN Serrate RNA effector molecule homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SRRT PE=1 SV=1 1 13 13 13 0 6 9 0 6 9 0 6 9 17.9 17.9 17.9 100.67 876 876 2 3 16 3 0 111.82 By MS/MS By MS/MS 0 9.7 11 140400000 0 29161000 111240000 0 12773000 24585000 0 6 9 15 1929 2785;3272;3344;4104;5189;6149;6150;6512;8057;9538;10117;11133;11648 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 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DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=POLR3F PE=1 SV=1 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 3.5 3.5 3.5 35.684 316 316 6 1 0.00099502 7.4853 By MS/MS 0 0 3.5 2117800 0 0 2117800 0 0 316840 0 0 1 1 1967 8453 True 8797 36190 30368 30368 Q9H1E3 Q9H1E3 4 4 4 Nuclear ubiquitous casein and cyclin-dependent kinase substrate 1 NUCKS1 sp|Q9H1E3|NUCKS_HUMAN Nuclear ubiquitous casein and cyclin-dependent kinase substrate 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NUCKS1 PE=1 SV=1 1 4 4 4 0 2 3 0 2 3 0 2 3 21.4 21.4 21.4 27.296 243 243 5.89 2 6 1 0 63.62 By MS/MS By MS/MS 0 13.6 15.2 38438000 0 4552900 33885000 0 0 4997500 0 2 5 7 1968 10512;13592;13593;15248 True;True;True;True 11073;14283;14284;15995 45492;45493;59339;59340;59341;59342;59343;66809;66810 37855;37856;49671;49672;49673;49674;56350 37856;49671;49674;56350 Q9H1I8 Q9H1I8 3 3 3 Activating signal cointegrator 1 complex subunit 2 ASCC2 sp|Q9H1I8|ASCC2_HUMAN Activating signal cointegrator 1 complex subunit 2 OS=Homo sapiens 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accessibility complex protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CHRAC1 PE=1 SV=1 1 2 2 2 0 2 2 0 2 2 0 2 2 19.8 19.8 19.8 14.71 131 131 8.67 2 4 0 19.342 By MS/MS By MS/MS 0 19.8 19.8 72744000 0 11047000 61696000 0 8692000 19789000 0 2 3 5 2043 8094;12625 True;True 8429;13283 34535;34536;34537;54899;54900;54901 28999;29000;45869;45870;45871 29000;45871 Q9NRG9 Q9NRG9 4 4 4 Aladin AAAS sp|Q9NRG9|AAAS_HUMAN Aladin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AAAS PE=1 SV=1 1 4 4 4 0 1 4 0 1 4 0 1 4 9.3 9.3 9.3 59.573 546 546 3.71 2 5 0 29.482 By MS/MS By MS/MS 0 2.4 9.3 41030000 0 2029100 39001000 0 0 6482200 0 1 4 5 2044 4958;5689;6120;8439 True;True;True;True 5166;5927;6378;8783 20801;20802;20803;23972;26085;26086;36160 17449;17450;20258;22054;30347 17450;20258;22054;30347 Q9NRL2 Q9NRL2 10 10 10 Bromodomain adjacent to zinc finger domain protein 1A BAZ1A sp|Q9NRL2|BAZ1A_HUMAN Bromodomain adjacent to zinc finger domain protein 1A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=BAZ1A PE=1 SV=2 1 10 10 10 0 1 10 0 1 10 0 1 10 11.1 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Sphingomyelin phosphodiesterase 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SMPD4 PE=1 SV=3 1 3 3 3 1 0 2 1 0 2 1 0 2 4.6 4.6 4.6 97.809 866 866 5.33 2 1 0 21.158 By MS/MS By MS/MS 0.8 0 3.8 8957500 1719800 0 7237700 0 0 1403800 1 0 2 3 2088 7826;7830;8940 True;True;True 8149;8153;9306 33349;33358;38122 28048;28055;31924 28048;28055;31924 Q9NXF1 Q9NXF1 16 16 16 Testis-expressed sequence 10 protein TEX10 sp|Q9NXF1|TEX10_HUMAN Testis-expressed protein 10 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TEX10 PE=1 SV=2 1 16 16 16 3 11 16 3 11 16 3 11 16 25.7 25.7 25.7 105.67 929 929 2.45 4 31 14 1 1 1 1 0 267.63 By matching By MS/MS By MS/MS 4.2 15 25.7 1176600000 3591500 65363000 1107700000 13228000 113730000 102110000 0 12 26 38 2089 355;1483;2622;3807;6726;7377;8306;9046;9307;10062;10401;12527;13177;14371;14576;15429 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 370;1554;2736;3964;7013;7677;8647;9414;9681;10591;10955;13181;13852;15090;15308;16179 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Ribosome-binding protein 1 RRBP1 sp|Q9P2E9|RRBP1_HUMAN Ribosome-binding protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RRBP1 PE=1 SV=5 2 19 19 19 2 6 18 2 6 18 2 6 18 20.1 20.1 20.1 152.45 1410 1410;2090 1.96 22 19 4 2 1 1 1 0 320.6 By matching By MS/MS By MS/MS 1.7 7.2 18 359450000 5722800 17507000 336220000 6472100 5851800 72032000 0 7 27 34 2122 992;1079;1599;2770;5413;5511;8037;8144;8153;8197;8831;12003;12019;12747;12889;13413;13449;13626;14200 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1045;1136;1671;2887;5635;5739;8370;8480;8490;8536;9195;12631;12647;13406;13553;14094;14132;14318;14915 4297;4298;4299;4300;4301;4302;4665;4666;7060;11552;11553;22652;23123;23124;23125;34331;34766;34767;34818;34819;34820;34821;34822;34823;34824;35068;35069;37720;51955;52006;52007;52008;52009;55491;55492;56161;56162;56163;58539;58540;58541;58695;58696;58697;58698;59461;59462;62412;62413;62414 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3262;3582;5933;8716;10719;14469 12888;14052;24014;35858;35859;35860;43651;60220;60221 10525;11532;20307;30113;30114;36302;50426;50427 10525;11532;20307;30113;36302;50426 Q9UBI6 Q9UBI6 1 1 1 Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(O) subunit gamma-12 GNG12 sp|Q9UBI6|GBG12_HUMAN Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(O) subunit gamma-12 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GNG12 PE=1 SV=3 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 22.2 22.2 22.2 8.0061 72 72 9.67 1 2 0.0023798 6.9564 By MS/MS By MS/MS 0 22.2 22.2 10722000 0 1916600 8805700 0 0 9752600 0 1 2 3 2131 11758 True 12373 50788;50789;50790 42220;42221;42222 42221 Q9UBL3 Q9UBL3 1 1 1 Set1/Ash2 histone methyltransferase complex subunit ASH2 ASH2L sp|Q9UBL3|ASH2L_HUMAN Set1/Ash2 histone methyltransferase complex subunit ASH2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ASH2L PE=1 SV=1 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 2.9 2.9 2.9 68.722 628 628 3 1 0.001039 8.8657 By MS/MS 0 0 2.9 9898700 0 0 9898700 0 0 1919900 0 0 1 1 2132 7970 True 8300 33998 28563 28563 Q9UBQ5 Q9UBQ5 2 2 2 Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit K EIF3K sp|Q9UBQ5|EIF3K_HUMAN Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit K OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EIF3K PE=1 SV=1 1 2 2 2 0 2 2 0 2 2 0 2 2 8.3 8.3 8.3 25.059 218 218 7 4 0 11.605 By MS/MS By MS/MS 0 8.3 8.3 18411000 0 5207300 13204000 0 3195600 2137400 0 1 1 2 2133 938;15845 True;True 979;16606 3944;3945;69255;69256 3232;58353 3232;58353 Q9UBS4 Q9UBS4 6 6 6 DnaJ homolog subfamily B member 11 DNAJB11 sp|Q9UBS4|DJB11_HUMAN DnaJ homolog subfamily B member 11 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DNAJB11 PE=1 SV=1 1 6 6 6 0 1 5 0 1 5 0 1 5 19 19 19 40.513 358 358 5 7 0 46.122 By MS/MS By MS/MS 0 2.2 16.8 72301000 0 2953800 69347000 0 0 9672600 0 1 6 7 2134 1734;3208;3916;3917;7010;7445 True;True;True;True;True;True 1811;3338;4080;4081;7301;7748 7573;13138;16150;16151;16152;29847;31668 6300;10728;13350;13351;13352;25245;26710 6300;10728;13350;13351;25245;26710 Q9UBU8;Q15014 Q9UBU8 4;1 4;1 4;1 Mortality factor 4-like protein 1 MORF4L1 sp|Q9UBU8|MO4L1_HUMAN Mortality factor 4-like protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MORF4L1 PE=1 SV=2 2 4 4 4 0 1 4 0 1 4 0 1 4 13.8 13.8 13.8 41.473 362 362;288 5.25 1 4 3 0 27.799 By MS/MS By MS/MS 0 3.6 13.8 31485000 0 12052000 19433000 0 3886500 0 0 1 4 5 2135 5907;10571;14128;15597 True;True;True;True 6153;11138;14839;16349 24916;24917;24918;24919;45747;45748;62163;68201 21006;21007;38057;52491;57518 21007;38057;52491;57518 Q9UBU9 Q9UBU9 13 13 13 Nuclear RNA export factor 1 NXF1 sp|Q9UBU9|NXF1_HUMAN Nuclear RNA export factor 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NXF1 PE=1 SV=1 1 13 13 13 0 8 12 0 8 12 0 8 12 28.6 28.6 28.6 70.182 619 619 3.1 1 1 21 6 0 114.68 By MS/MS By MS/MS 0 14.2 26.7 233280000 0 55510000 177770000 0 27230000 30611000 0 9 12 21 2136 666;1082;1488;2135;6009;6212;6517;7567;7661;11640;11706;11755;15849 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 694;1139;1559;2231;6257;6473;6796;7878;7976;12244;12313;12370;16610 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ZNHIT2 sp|Q9UHR6|ZNHI2_HUMAN Zinc finger HIT domain-containing protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ZNHIT2 PE=1 SV=1 1 1 1 1 0 1 0 0 1 0 0 1 0 4 4 4 42.883 403 403 5 1 0.0023563 6.8374 By MS/MS 0 4 0 1577600 0 1577600 0 0 406670 0 0 1 0 1 2156 5238 True 5452 21961 18464 18464 Q9UHV9 Q9UHV9 1 1 1 Prefoldin subunit 2 PFDN2 sp|Q9UHV9|PFD2_HUMAN Prefoldin subunit 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PFDN2 PE=1 SV=1 1 1 1 1 0 1 0 0 1 0 0 1 0 7.8 7.8 7.8 16.648 154 154 8 1 0 38.284 By MS/MS 0 7.8 0 10195000 0 10195000 0 0 4638200 0 0 1 0 1 2157 6013 True 6261 25408 21450 21450 Q9UHX1 Q9UHX1 12 12 12 Poly(U)-binding-splicing factor PUF60 PUF60 sp|Q9UHX1|PUF60_HUMAN Poly(U)-binding-splicing factor PUF60 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PUF60 PE=1 SV=1 1 12 12 12 2 7 11 2 7 11 2 7 11 29.7 29.7 29.7 59.875 559 559 3.6 2 3 13 20 3 1 1 0 300.7 By matching By MS/MS By MS/MS 2.9 20.9 27.9 483760000 6388800 199120000 278250000 17184000 61204000 47024000 0 9 20 29 2158 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condensation inducer in the nucleus OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ACIN1 PE=1 SV=2 1 28 28 28 2 14 24 2 14 24 2 14 24 23 23 23 151.86 1341 1341 2.33 28 23 29 5 4 1 0 323.31 By matching By MS/MS By MS/MS 1.4 13.9 19.9 805310000 6497400 168230000 630580000 19971000 62675000 129420000 0 25 41 66 2184 129;1224;2662;2998;4200;4711;5143;5144;6491;6534;6535;7167;7310;8203;8942;10693;10728;11707;11973;12500;13009;13010;13160;13161;13888;14530;14900;15182 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 132;1282;2776;3121;4374;4911;5356;5357;6767;6813;6814;7462;7610;8542;9308;11263;11300;12314;12599;13153;13676;13677;13834;13835;14596;15258;15641;15925 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Q9UM54 Q9UM54 25 25 25 Unconventional myosin-VI MYO6 sp|Q9UM54|MYO6_HUMAN Unconventional myosin-VI OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MYO6 PE=1 SV=4 1 25 25 25 1 22 11 1 22 11 1 22 11 24.1 24.1 24.1 149.69 1294 1294 1.77 12 34 1 0 241.67 By matching By MS/MS By MS/MS 0.9 20.7 11.5 257850000 6877100 170940000 80033000 0 68264000 27260000 0 24 12 36 2198 763;2933;3873;5720;5941;6178;6353;6397;6653;8833;9243;10164;10239;10774;10821;10974;11385;12196;12581;12655;12680;12709;13079;13899;15796 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 796;3056;4034;5959;6188;6436;6624;6671;6936;9197;9617;10701;10779;11349;11398;11556;11975;12833;13239;13313;13338;13367;13750;14607;16555 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STUB1 sp|Q9UNE7|CHIP_HUMAN E3 ubiquitin-protein ligase CHIP OS=Homo sapiens OX=9606 GN=STUB1 PE=1 SV=2 1 4 4 4 0 4 4 0 4 4 0 4 4 15.5 15.5 15.5 34.856 303 303 6.15 11 2 0 69.89 By MS/MS By MS/MS 0 15.5 15.5 160670000 0 29216000 131450000 0 9344700 20546000 0 3 6 9 2204 5984;6503;8566;12443 True;True;True;True 6231;6781;8918;13095 25275;25276;25277;25278;25279;25280;25281;27667;27668;36736;36737;54046;54047 21339;21340;21341;21342;23398;23399;30826;45167;45168 21341;23398;30826;45167 Q9UNF0 Q9UNF0 1 1 1 Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2 PACSIN2 sp|Q9UNF0|PACN2_HUMAN Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PACSIN2 PE=1 SV=2 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 2.3 2.3 2.3 55.738 486 486 3 1 0.0023992 7.0823 By MS/MS 0 0 2.3 5044700 0 0 5044700 0 0 978430 0 0 1 1 2205 656 True 684 2801 2299 2299 Q9UNF1 Q9UNF1 3 3 3 Melanoma-associated antigen D2 MAGED2 sp|Q9UNF1|MAGD2_HUMAN Melanoma-associated antigen D2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MAGED2 PE=1 SV=2 1 3 3 3 0 1 2 0 1 2 0 1 2 6.6 6.6 6.6 64.953 606 606 2.75 1 3 0 20.72 By MS/MS By MS/MS 0 2.1 4.5 11100000 0 903520 10196000 0 0 2072400 0 1 2 3 2206 8860;12578;14929 True;True;True 9225;13236;15670 37799;54677;54678;65462 31659;45695;55166 31659;45695;55166 Q9UNL4 Q9UNL4 2 2 2 Inhibitor of growth protein 4 ING4 sp|Q9UNL4|ING4_HUMAN Inhibitor of growth protein 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ING4 PE=1 SV=1 1 2 2 2 0 0 2 0 0 2 0 0 2 7.2 7.2 7.2 28.53 249 249 6.33 2 1 0 11.201 By MS/MS 0 0 7.2 21428000 0 0 21428000 0 0 3323800 0 0 2 2 2207 7514;11413 True;True 7822;12004 31996;49310;49311 26976;41074 26976;41074 Q9UNM6 Q9UNM6 1 1 1 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 13 PSMD13 sp|Q9UNM6|PSD13_HUMAN 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 13 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PSMD13 PE=1 SV=2 1 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 4 4 4 42.945 376 376 5 1 0.001002 7.5485 By MS/MS 4 0 0 6615200 6615200 0 0 5299600 0 0 1 0 0 1 2208 12317 True 12958 53568 44792 44792 Q9UNP9 Q9UNP9 2 2 2 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase E PPIE sp|Q9UNP9|PPIE_HUMAN Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase E OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PPIE PE=1 SV=1 1 2 2 2 0 1 2 0 1 2 0 1 2 8.3 8.3 8.3 33.43 301 301 6 3 0 13.646 By MS/MS By MS/MS 0 3.3 8.3 19639000 0 6256700 13382000 0 0 2002100 0 1 1 2 2209 5637;12378 True;True 5872;13030 23808;53846;53847 20116;45007 20116;45007 Q9UNQ2 Q9UNQ2 6 6 6 Probable dimethyladenosine transferase DIMT1 sp|Q9UNQ2|DIM1_HUMAN Probable dimethyladenosine transferase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DIMT1 PE=1 SV=1 1 6 6 6 1 5 5 1 5 5 1 5 5 22.7 22.7 22.7 35.236 313 313 6 1 12 1 0 50.958 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 4.2 19.5 17.3 112420000 4353400 53115000 54947000 0 14924000 11571000 1 6 4 11 2210 8309;8871;8984;10411;11671;12573 True;True;True;True;True;True 8650;9237;9350;10965;12276;13231 35593;35594;35595;35596;37845;37846;37847;38259;38260;45019;45020;50341;50342;54668 29869;29870;29871;29872;31699;32028;32029;37467;37468;41836;45689 29869;31699;32029;37467;41836;45689 Q9UNS2 Q9UNS2 2 2 2 COP9 signalosome complex subunit 3 COPS3 sp|Q9UNS2|CSN3_HUMAN COP9 signalosome complex subunit 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=COPS3 PE=1 SV=3 1 2 2 2 2 1 1 2 1 1 2 1 1 6.6 6.6 6.6 47.873 423 423 5.57 1 1 1 1 3 2 2 1 1 1 0 15.614 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 6.6 2.8 3.8 221380000 110670000 2570600 108130000 92195000 0 0 3 2 3 8 2211 1168;15843 True;True 1225;16604 5113;5114;5115;69243;69244;69245;69246;69247;69248;69249;69250;69251;69252;69253 4215;4216;4217;58347;58348;58349;58350;58351 4215;58347 707;708 372;380 Q9UNX4 Q9UNX4 12 12 12 WD repeat-containing protein 3 WDR3 sp|Q9UNX4|WDR3_HUMAN WD repeat-containing protein 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=WDR3 PE=1 SV=1 1 12 12 12 1 8 8 1 8 8 1 8 8 17.8 17.8 17.8 106.1 943 943 2.3 8 16 3 1 2 0 120.05 By matching By MS/MS By MS/MS 1.1 11.5 11.8 112280000 1902900 51491000 58884000 0 26019000 9846300 0 10 9 19 2212 1389;1595;2299;2300;4811;5887;5975;6172;8104;11862;12582;13431 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1456;1667;2401;2402;5014;6133;6222;6430;8439;12481;13240;14114 6134;6135;7045;7046;7047;7048;7049;7050;7051;7052;9772;9773;9774;9775;9776;20311;24840;25214;25215;25216;26243;26244;26245;26246;34605;51324;51325;54688;54689;58622 5074;5867;5868;5869;5870;5871;7994;7995;7996;17041;20950;21230;21231;22167;22168;29060;42671;45702;49069 5074;5868;7994;7995;17041;20950;21230;22167;29060;42671;45702;49069 Q9UNY4 Q9UNY4 3 3 3 Transcription termination factor 2 TTF2 sp|Q9UNY4|TTF2_HUMAN Transcription termination factor 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TTF2 PE=1 SV=2 1 3 3 3 0 1 3 0 1 3 0 1 3 3.4 3.4 3.4 129.59 1162 1162 1.83 2 3 1 0 18.972 By matching By MS/MS 0 1.1 3.4 12787000 0 1222300 11564000 0 0 2538800 0 0 2 2 2213 6549;6622;12506 True;True;True 6828;6903;13159 27932;27933;27934;28240;54244;54245 23705;23953;45335 23705;23953;45335 Q9UPN3 Q9UPN3 5 5 5 Microtubule-actin cross-linking factor 1, isoforms 1/2/3/5 MACF1 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3017;3018;8053;16228;20690;22615;22616;22617;31388;34842;34843;34844;37786;37787;38066;47994;47995;48755;49155;49156;51521;61655;61656 2478;2479;6672;13426;17366;19018;19019;26480;29231;31649;31883;40025;40620;40950;42827;51950;51951 2479;6672;13426;17366;19018;19019;26480;29231;31649;31883;40025;40620;40950;42827;51951 Q9UPN6 Q9UPN6 2 2 1 Protein SCAF8 SCAF8 sp|Q9UPN6|SCAF8_HUMAN SR-related and CTD-associated factor 8 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SCAF8 PE=1 SV=1 1 2 2 1 0 2 1 0 2 1 0 1 0 2 2 1.1 140.52 1271 1271 6.33 1 1 2 2 0 11.606 By MS/MS By MS/MS 0 2 0.9 10480000 0 3976200 6503700 0 1878900 0 0 3 1 4 2216 3985;14912 True;True 4152;15653 16370;65395;65396;65397;65398;65399 13517;55117;55118;55119 13517;55118 Q9UPT9 Q9UPT9 1 1 1 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22 USP22 sp|Q9UPT9|UBP22_HUMAN Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=USP22 PE=1 SV=2 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 4.4 4.4 4.4 59.96 525 525 4 1 0.0010655 10.727 By MS/MS 0 0 4.4 2973600 0 0 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U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UTP18 PE=1 SV=3 1 7 7 7 1 5 7 1 5 7 1 5 7 15.5 15.5 15.5 62.003 556 556 3.62 2 9 6 3 1 0 54.796 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 1.3 10.3 15.5 398330000 24265000 114870000 259200000 0 38916000 49488000 1 6 8 15 2297 446;4058;6444;7986;10167;13143;13957 True;True;True;True;True;True;True 464;4228;6719;8317;10704;13816;14665 1839;1840;16707;16708;16709;16710;27390;27391;27392;34108;34109;34110;34111;43615;43616;57035;57036;57037;57038;57039;61407 1477;13849;13850;13851;13852;23143;23144;28683;28684;36278;36279;47624;47625;47626;51717 1477;13851;23143;28683;36279;47626;51717 Q9Y5L4 Q9Y5L4 3 3 3 Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim13 TIMM13 sp|Q9Y5L4|TIM13_HUMAN Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim13 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TIMM13 PE=1 SV=1 1 3 3 3 1 3 1 1 3 1 1 3 1 36.8 36.8 36.8 10.5 95 95 9.83 1 5 0 29.065 By MS/MS By MS/MS By MS/MS 14.7 36.8 14.7 47114000 865270 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